Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC44.39■■■■■ 4.7
SMARCA2P51531 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC44.39■■■■■ 4.7
SMARCA2P51531 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
SMARCA2P51531 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
SMARCA2P51531 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC44.39■■■■■ 4.7
SMARCA2P51531 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.38■■■■■ 4.69
SMARCA2P51531 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
SMARCA2P51531 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
SMARCA2P51531 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC44.37■■■■■ 4.69
SMARCA2P51531 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC44.36■■■■■ 4.69
SMARCA2P51531 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
SMARCA2P51531 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
SMARCA2P51531 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC44.34■■■■■ 4.69
SMARCA2P51531 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC44.33■■■■■ 4.69
SMARCA2P51531 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.33■■■■■ 4.69
SMARCA2P51531 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC44.32■■■■■ 4.69
SMARCA2P51531 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC44.32■■■■■ 4.69
SMARCA2P51531 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC44.32■■■■■ 4.69
SMARCA2P51531 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
SMARCA2P51531 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC44.31■■■■■ 4.68
SMARCA2P51531 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC44.31■■■■■ 4.68
SMARCA2P51531 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
SMARCA2P51531 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
SMARCA2P51531 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC44.3■■■■■ 4.68
SMARCA2P51531 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
SMARCA2P51531 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
SMARCA2P51531 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
SMARCA2P51531 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC44.28■■■■■ 4.68
SMARCA2P51531 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
SMARCA2P51531 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC44.28■■■■■ 4.68
SMARCA2P51531 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
SMARCA2P51531 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
SMARCA2P51531 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC44.26■■■■■ 4.68
SMARCA2P51531 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
SMARCA2P51531 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
SMARCA2P51531 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC44.25■■■■■ 4.67
SMARCA2P51531 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
SMARCA2P51531 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
SMARCA2P51531 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.24■■■■■ 4.67
SMARCA2P51531 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.24■■■■■ 4.67
SMARCA2P51531 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
SMARCA2P51531 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
SMARCA2P51531 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC44.22■■■■■ 4.67
SMARCA2P51531 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
SMARCA2P51531 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
SMARCA2P51531 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC44.21■■■■■ 4.67
SMARCA2P51531 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
SMARCA2P51531 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
SMARCA2P51531 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.2■■■■■ 4.67
SMARCA2P51531 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.2■■■■■ 4.67
SMARCA2P51531 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.67
SMARCA2P51531 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC44.19■■■■■ 4.66
SMARCA2P51531 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC44.19■■■■■ 4.66
SMARCA2P51531 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC44.18■■■■■ 4.66
SMARCA2P51531 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC44.18■■■■■ 4.66
SMARCA2P51531 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC44.18■■■■■ 4.66
SMARCA2P51531 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC44.18■■■■■ 4.66
SMARCA2P51531 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC44.18■■■■■ 4.66
SMARCA2P51531 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC44.18■■■■■ 4.66
SMARCA2P51531 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
SMARCA2P51531 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC44.18■■■■■ 4.66
SMARCA2P51531 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
SMARCA2P51531 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.17■■■■■ 4.66
SMARCA2P51531 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
SMARCA2P51531 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC44.16■■■■■ 4.66
SMARCA2P51531 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
SMARCA2P51531 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC44.16■■■■■ 4.66
SMARCA2P51531 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
SMARCA2P51531 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC44.14■■■■■ 4.66
SMARCA2P51531 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC44.14■■■■■ 4.66
SMARCA2P51531 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC44.14■■■■■ 4.66
SMARCA2P51531 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC44.14■■■■■ 4.66
SMARCA2P51531 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
SMARCA2P51531 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC44.14■■■■■ 4.66
SMARCA2P51531 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
SMARCA2P51531 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC44.13■■■■■ 4.65
SMARCA2P51531 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
SMARCA2P51531 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
SMARCA2P51531 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
SMARCA2P51531 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
SMARCA2P51531 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC44.11■■■■■ 4.65
SMARCA2P51531 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
SMARCA2P51531 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC44.1■■■■■ 4.65
SMARCA2P51531 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
SMARCA2P51531 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC44.1■■■■■ 4.65
SMARCA2P51531 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.1■■■■■ 4.65
SMARCA2P51531 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
SMARCA2P51531 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
SMARCA2P51531 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC44.09■■■■■ 4.65
SMARCA2P51531 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
SMARCA2P51531 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
SMARCA2P51531 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
SMARCA2P51531 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
SMARCA2P51531 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC44.08■■■■■ 4.65
SMARCA2P51531 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC44.08■■■■■ 4.65
SMARCA2P51531 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
SMARCA2P51531 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
SMARCA2P51531 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC44.07■■■■■ 4.65
SMARCA2P51531 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.06■■■■■ 4.64
SMARCA2P51531 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC44.06■■■■■ 4.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms