Protein–RNA interactions for Protein: P48066

SLC6A11, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A11P48066 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC6A11P48066 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC6A11P48066 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC6A11P48066 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC6A11P48066 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC6A11P48066 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC6A11P48066 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC6A11P48066 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC6A11P48066 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC6A11P48066 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC6A11P48066 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC6A11P48066 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC6A11P48066 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC6A11P48066 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC6A11P48066 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC6A11P48066 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC6A11P48066 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC6A11P48066 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC6A11P48066 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC6A11P48066 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC6A11P48066 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC6A11P48066 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC6A11P48066 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC6A11P48066 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC6A11P48066 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC6A11P48066 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC6A11P48066 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC6A11P48066 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC6A11P48066 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC6A11P48066 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC6A11P48066 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC6A11P48066 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC6A11P48066 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC6A11P48066 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC6A11P48066 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC6A11P48066 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC6A11P48066 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC6A11P48066 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC6A11P48066 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC6A11P48066 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC6A11P48066 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC6A11P48066 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC6A11P48066 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC6A11P48066 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC6A11P48066 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC6A11P48066 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC6A11P48066 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC6A11P48066 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC6A11P48066 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC6A11P48066 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC6A11P48066 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC6A11P48066 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC6A11P48066 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC6A11P48066 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC6A11P48066 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC6A11P48066 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC6A11P48066 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC6A11P48066 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC6A11P48066 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC6A11P48066 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC6A11P48066 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC6A11P48066 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC6A11P48066 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC6A11P48066 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC6A11P48066 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC6A11P48066 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC6A11P48066 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC6A11P48066 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC6A11P48066 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC6A11P48066 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC6A11P48066 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC6A11P48066 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC6A11P48066 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC6A11P48066 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC6A11P48066 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC6A11P48066 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC6A11P48066 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC6A11P48066 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC6A11P48066 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC6A11P48066 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC6A11P48066 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC6A11P48066 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC6A11P48066 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC6A11P48066 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC6A11P48066 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC6A11P48066 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC6A11P48066 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC6A11P48066 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC6A11P48066 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC6A11P48066 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC6A11P48066 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC6A11P48066 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC6A11P48066 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC6A11P48066 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC6A11P48066 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC6A11P48066 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC6A11P48066 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC6A11P48066 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC6A11P48066 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC6A11P48066 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms