Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPL9P32969 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPL9P32969 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPL9P32969 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPL9P32969 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPL9P32969 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPL9P32969 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPL9P32969 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPL9P32969 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPL9P32969 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPL9P32969 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPL9P32969 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPL9P32969 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPL9P32969 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RPL9P32969 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RPL9P32969 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPL9P32969 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPL9P32969 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPL9P32969 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPL9P32969 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPL9P32969 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPL9P32969 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPL9P32969 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPL9P32969 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPL9P32969 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPL9P32969 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPL9P32969 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPL9P32969 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPL9P32969 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPL9P32969 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPL9P32969 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPL9P32969 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPL9P32969 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPL9P32969 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPL9P32969 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPL9P32969 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPL9P32969 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPL9P32969 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPL9P32969 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPL9P32969 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RPL9P32969 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPL9P32969 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPL9P32969 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPL9P32969 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPL9P32969 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RPL9P32969 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPL9P32969 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPL9P32969 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPL9P32969 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPL9P32969 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPL9P32969 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPL9P32969 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPL9P32969 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPL9P32969 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPL9P32969 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPL9P32969 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPL9P32969 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPL9P32969 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RPL9P32969 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPL9P32969 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPL9P32969 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPL9P32969 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPL9P32969 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPL9P32969 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPL9P32969 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RPL9P32969 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPL9P32969 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPL9P32969 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPL9P32969 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPL9P32969 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPL9P32969 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPL9P32969 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPL9P32969 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPL9P32969 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPL9P32969 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPL9P32969 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPL9P32969 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPL9P32969 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPL9P32969 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPL9P32969 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPL9P32969 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPL9P32969 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RPL9P32969 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPL9P32969 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPL9P32969 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPL9P32969 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPL9P32969 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPL9P32969 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPL9P32969 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPL9P32969 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPL9P32969 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RPL9P32969 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPL9P32969 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPL9P32969 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RPL9P32969 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPL9P32969 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPL9P32969 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPL9P32969 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPL9P32969 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPL9P32969 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms