Protein–RNA interactions for Protein: P32004

L1CAM, Neural cell adhesion molecule L1, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1CAMP32004 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
L1CAMP32004 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
L1CAMP32004 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
L1CAMP32004 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
L1CAMP32004 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
L1CAMP32004 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
L1CAMP32004 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
L1CAMP32004 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
L1CAMP32004 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
L1CAMP32004 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
L1CAMP32004 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
L1CAMP32004 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
L1CAMP32004 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
L1CAMP32004 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
L1CAMP32004 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
L1CAMP32004 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
L1CAMP32004 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
L1CAMP32004 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
L1CAMP32004 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
L1CAMP32004 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
L1CAMP32004 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
L1CAMP32004 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
L1CAMP32004 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
L1CAMP32004 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
L1CAMP32004 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
L1CAMP32004 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
L1CAMP32004 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
L1CAMP32004 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
L1CAMP32004 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
L1CAMP32004 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
L1CAMP32004 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
L1CAMP32004 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
L1CAMP32004 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
L1CAMP32004 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
L1CAMP32004 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
L1CAMP32004 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
L1CAMP32004 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
L1CAMP32004 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
L1CAMP32004 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
L1CAMP32004 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
L1CAMP32004 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
L1CAMP32004 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
L1CAMP32004 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
L1CAMP32004 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
L1CAMP32004 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
L1CAMP32004 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
L1CAMP32004 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
L1CAMP32004 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
L1CAMP32004 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
L1CAMP32004 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
L1CAMP32004 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
L1CAMP32004 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
L1CAMP32004 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
L1CAMP32004 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
L1CAMP32004 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
L1CAMP32004 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
L1CAMP32004 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
L1CAMP32004 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
L1CAMP32004 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
L1CAMP32004 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
L1CAMP32004 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
L1CAMP32004 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
L1CAMP32004 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
L1CAMP32004 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
L1CAMP32004 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
L1CAMP32004 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
L1CAMP32004 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
L1CAMP32004 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
L1CAMP32004 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
L1CAMP32004 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
L1CAMP32004 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
L1CAMP32004 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
L1CAMP32004 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
L1CAMP32004 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
L1CAMP32004 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
L1CAMP32004 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
L1CAMP32004 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
L1CAMP32004 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
L1CAMP32004 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
L1CAMP32004 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
L1CAMP32004 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
L1CAMP32004 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
L1CAMP32004 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
L1CAMP32004 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
L1CAMP32004 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
L1CAMP32004 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
L1CAMP32004 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
L1CAMP32004 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
L1CAMP32004 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
L1CAMP32004 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
L1CAMP32004 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
L1CAMP32004 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
L1CAMP32004 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
L1CAMP32004 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
L1CAMP32004 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
L1CAMP32004 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
L1CAMP32004 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
L1CAMP32004 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
L1CAMP32004 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
L1CAMP32004 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms