Protein–RNA interactions for Protein: P29323

EPHB2, Ephrin type-B receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB2P29323 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPHB2P29323 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPHB2P29323 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPHB2P29323 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPHB2P29323 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPHB2P29323 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPHB2P29323 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHB2P29323 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHB2P29323 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHB2P29323 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHB2P29323 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHB2P29323 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHB2P29323 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHB2P29323 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHB2P29323 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHB2P29323 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHB2P29323 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPHB2P29323 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPHB2P29323 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPHB2P29323 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPHB2P29323 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPHB2P29323 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPHB2P29323 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPHB2P29323 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPHB2P29323 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPHB2P29323 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
EPHB2P29323 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPHB2P29323 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPHB2P29323 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPHB2P29323 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPHB2P29323 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPHB2P29323 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPHB2P29323 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPHB2P29323 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPHB2P29323 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPHB2P29323 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPHB2P29323 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPHB2P29323 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPHB2P29323 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPHB2P29323 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
EPHB2P29323 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
EPHB2P29323 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
EPHB2P29323 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPHB2P29323 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPHB2P29323 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPHB2P29323 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPHB2P29323 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPHB2P29323 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPHB2P29323 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPHB2P29323 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPHB2P29323 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPHB2P29323 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPHB2P29323 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB2P29323 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB2P29323 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB2P29323 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB2P29323 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB2P29323 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB2P29323 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB2P29323 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB2P29323 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPHB2P29323 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPHB2P29323 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPHB2P29323 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
EPHB2P29323 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EPHB2P29323 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EPHB2P29323 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EPHB2P29323 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EPHB2P29323 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EPHB2P29323 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPHB2P29323 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPHB2P29323 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPHB2P29323 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPHB2P29323 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPHB2P29323 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPHB2P29323 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPHB2P29323 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPHB2P29323 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPHB2P29323 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPHB2P29323 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPHB2P29323 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPHB2P29323 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPHB2P29323 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPHB2P29323 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPHB2P29323 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPHB2P29323 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPHB2P29323 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPHB2P29323 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPHB2P29323 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPHB2P29323 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPHB2P29323 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPHB2P29323 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPHB2P29323 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPHB2P29323 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
EPHB2P29323 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPHB2P29323 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPHB2P29323 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPHB2P29323 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPHB2P29323 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPHB2P29323 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms