Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTGFP29279 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTGFP29279 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTGFP29279 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTGFP29279 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTGFP29279 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CTGFP29279 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CTGFP29279 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTGFP29279 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTGFP29279 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTGFP29279 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTGFP29279 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTGFP29279 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTGFP29279 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CTGFP29279 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTGFP29279 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTGFP29279 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CTGFP29279 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTGFP29279 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTGFP29279 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTGFP29279 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTGFP29279 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTGFP29279 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTGFP29279 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CTGFP29279 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTGFP29279 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTGFP29279 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTGFP29279 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTGFP29279 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTGFP29279 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTGFP29279 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTGFP29279 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTGFP29279 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTGFP29279 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTGFP29279 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTGFP29279 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTGFP29279 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTGFP29279 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CTGFP29279 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTGFP29279 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTGFP29279 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTGFP29279 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTGFP29279 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTGFP29279 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTGFP29279 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTGFP29279 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTGFP29279 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTGFP29279 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTGFP29279 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTGFP29279 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTGFP29279 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTGFP29279 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTGFP29279 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTGFP29279 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTGFP29279 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTGFP29279 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTGFP29279 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTGFP29279 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTGFP29279 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTGFP29279 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTGFP29279 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTGFP29279 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTGFP29279 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTGFP29279 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTGFP29279 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTGFP29279 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CTGFP29279 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTGFP29279 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTGFP29279 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTGFP29279 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CTGFP29279 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTGFP29279 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTGFP29279 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTGFP29279 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTGFP29279 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTGFP29279 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTGFP29279 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CTGFP29279 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CTGFP29279 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CTGFP29279 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CTGFP29279 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
CTGFP29279 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTGFP29279 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CTGFP29279 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CTGFP29279 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTGFP29279 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTGFP29279 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CTGFP29279 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTGFP29279 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTGFP29279 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTGFP29279 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTGFP29279 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTGFP29279 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTGFP29279 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTGFP29279 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTGFP29279 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTGFP29279 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTGFP29279 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTGFP29279 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTGFP29279 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms