Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA3P26006 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA3P26006 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA3P26006 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA3P26006 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA3P26006 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA3P26006 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA3P26006 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA3P26006 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA3P26006 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA3P26006 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA3P26006 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA3P26006 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA3P26006 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA3P26006 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA3P26006 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA3P26006 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA3P26006 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA3P26006 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA3P26006 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA3P26006 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA3P26006 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA3P26006 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA3P26006 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA3P26006 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA3P26006 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA3P26006 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA3P26006 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA3P26006 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA3P26006 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA3P26006 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA3P26006 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA3P26006 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA3P26006 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA3P26006 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA3P26006 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA3P26006 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA3P26006 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA3P26006 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA3P26006 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA3P26006 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA3P26006 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA3P26006 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA3P26006 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA3P26006 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA3P26006 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA3P26006 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA3P26006 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA3P26006 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA3P26006 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA3P26006 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA3P26006 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA3P26006 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA3P26006 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA3P26006 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA3P26006 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA3P26006 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA3P26006 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA3P26006 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA3P26006 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA3P26006 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA3P26006 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA3P26006 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA3P26006 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA3P26006 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA3P26006 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA3P26006 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ITGA3P26006 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ITGA3P26006 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA3P26006 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA3P26006 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA3P26006 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA3P26006 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA3P26006 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA3P26006 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA3P26006 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA3P26006 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA3P26006 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA3P26006 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA3P26006 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA3P26006 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA3P26006 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA3P26006 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA3P26006 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA3P26006 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA3P26006 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA3P26006 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA3P26006 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA3P26006 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA3P26006 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA3P26006 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA3P26006 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA3P26006 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA3P26006 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA3P26006 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA3P26006 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA3P26006 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA3P26006 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA3P26006 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA3P26006 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms