Protein–RNA interactions for Protein: P25024

CXCR1, C-X-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR1P25024 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CXCR1P25024 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CXCR1P25024 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CXCR1P25024 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCR1P25024 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCR1P25024 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCR1P25024 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCR1P25024 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCR1P25024 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCR1P25024 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCR1P25024 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCR1P25024 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCR1P25024 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCR1P25024 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCR1P25024 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCR1P25024 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCR1P25024 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCR1P25024 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCR1P25024 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCR1P25024 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCR1P25024 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCR1P25024 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCR1P25024 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCR1P25024 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCR1P25024 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCR1P25024 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCR1P25024 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCR1P25024 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCR1P25024 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCR1P25024 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCR1P25024 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCR1P25024 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCR1P25024 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCR1P25024 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCR1P25024 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCR1P25024 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCR1P25024 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCR1P25024 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCR1P25024 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCR1P25024 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCR1P25024 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCR1P25024 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCR1P25024 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCR1P25024 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCR1P25024 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms