Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP2B1P20020 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP2B1P20020 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP2B1P20020 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP2B1P20020 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP2B1P20020 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP2B1P20020 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP2B1P20020 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP2B1P20020 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP2B1P20020 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP2B1P20020 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP2B1P20020 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP2B1P20020 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP2B1P20020 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP2B1P20020 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP2B1P20020 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP2B1P20020 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP2B1P20020 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP2B1P20020 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP2B1P20020 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP2B1P20020 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP2B1P20020 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP2B1P20020 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP2B1P20020 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP2B1P20020 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP2B1P20020 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP2B1P20020 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP2B1P20020 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP2B1P20020 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP2B1P20020 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP2B1P20020 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP2B1P20020 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP2B1P20020 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP2B1P20020 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP2B1P20020 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP2B1P20020 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP2B1P20020 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP2B1P20020 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP2B1P20020 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP2B1P20020 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP2B1P20020 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP2B1P20020 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP2B1P20020 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP2B1P20020 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP2B1P20020 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP2B1P20020 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP2B1P20020 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP2B1P20020 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP2B1P20020 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP2B1P20020 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP2B1P20020 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP2B1P20020 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP2B1P20020 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP2B1P20020 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP2B1P20020 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP2B1P20020 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP2B1P20020 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP2B1P20020 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP2B1P20020 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP2B1P20020 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP2B1P20020 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP2B1P20020 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP2B1P20020 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP2B1P20020 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP2B1P20020 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP2B1P20020 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP2B1P20020 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP2B1P20020 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP2B1P20020 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP2B1P20020 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP2B1P20020 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP2B1P20020 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP2B1P20020 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP2B1P20020 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP2B1P20020 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP2B1P20020 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP2B1P20020 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP2B1P20020 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP2B1P20020 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP2B1P20020 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP2B1P20020 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP2B1P20020 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP2B1P20020 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP2B1P20020 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP2B1P20020 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP2B1P20020 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP2B1P20020 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP2B1P20020 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP2B1P20020 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP2B1P20020 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP2B1P20020 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP2B1P20020 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP2B1P20020 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP2B1P20020 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP2B1P20020 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP2B1P20020 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP2B1P20020 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP2B1P20020 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP2B1P20020 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP2B1P20020 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms