Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOT1P17174 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOT1P17174 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOT1P17174 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOT1P17174 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOT1P17174 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOT1P17174 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOT1P17174 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOT1P17174 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOT1P17174 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOT1P17174 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOT1P17174 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOT1P17174 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GOT1P17174 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GOT1P17174 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOT1P17174 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOT1P17174 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOT1P17174 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOT1P17174 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOT1P17174 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOT1P17174 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOT1P17174 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOT1P17174 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOT1P17174 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GOT1P17174 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOT1P17174 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOT1P17174 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOT1P17174 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOT1P17174 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOT1P17174 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOT1P17174 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOT1P17174 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOT1P17174 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOT1P17174 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOT1P17174 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOT1P17174 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOT1P17174 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOT1P17174 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOT1P17174 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOT1P17174 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GOT1P17174 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOT1P17174 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOT1P17174 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOT1P17174 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOT1P17174 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GOT1P17174 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOT1P17174 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOT1P17174 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOT1P17174 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOT1P17174 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOT1P17174 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOT1P17174 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOT1P17174 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOT1P17174 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOT1P17174 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOT1P17174 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOT1P17174 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOT1P17174 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOT1P17174 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOT1P17174 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOT1P17174 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOT1P17174 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOT1P17174 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOT1P17174 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GOT1P17174 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOT1P17174 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOT1P17174 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOT1P17174 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOT1P17174 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOT1P17174 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOT1P17174 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOT1P17174 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOT1P17174 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOT1P17174 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOT1P17174 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOT1P17174 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOT1P17174 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GOT1P17174 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOT1P17174 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOT1P17174 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOT1P17174 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOT1P17174 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOT1P17174 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOT1P17174 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOT1P17174 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOT1P17174 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOT1P17174 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOT1P17174 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOT1P17174 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOT1P17174 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOT1P17174 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GOT1P17174 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOT1P17174 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOT1P17174 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOT1P17174 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GOT1P17174 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOT1P17174 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOT1P17174 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GOT1P17174 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GOT1P17174 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms