Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNNT1P13805 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNNT1P13805 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TNNT1P13805 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNNT1P13805 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNNT1P13805 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNNT1P13805 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNNT1P13805 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNNT1P13805 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNNT1P13805 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNNT1P13805 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNNT1P13805 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNNT1P13805 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TNNT1P13805 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNNT1P13805 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNNT1P13805 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNNT1P13805 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TNNT1P13805 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNNT1P13805 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNNT1P13805 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNNT1P13805 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNNT1P13805 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNNT1P13805 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNNT1P13805 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNNT1P13805 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNNT1P13805 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNNT1P13805 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNNT1P13805 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TNNT1P13805 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNNT1P13805 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNNT1P13805 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNNT1P13805 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TNNT1P13805 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNT1P13805 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNT1P13805 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNT1P13805 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNT1P13805 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNT1P13805 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNT1P13805 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNT1P13805 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNT1P13805 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNT1P13805 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNT1P13805 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNT1P13805 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNT1P13805 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNT1P13805 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNT1P13805 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNT1P13805 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNT1P13805 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNT1P13805 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNT1P13805 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNT1P13805 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNT1P13805 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNT1P13805 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNT1P13805 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNT1P13805 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNT1P13805 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNT1P13805 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNT1P13805 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNT1P13805 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNT1P13805 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNT1P13805 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNT1P13805 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNT1P13805 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNT1P13805 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNT1P13805 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNT1P13805 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNT1P13805 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNT1P13805 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNT1P13805 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNT1P13805 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNT1P13805 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNT1P13805 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNT1P13805 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNT1P13805 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
TNNT1P13805 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TNNT1P13805 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TNNT1P13805 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNNT1P13805 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNNT1P13805 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNT1P13805 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNT1P13805 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNT1P13805 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNT1P13805 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNT1P13805 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNT1P13805 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNT1P13805 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNT1P13805 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNT1P13805 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNT1P13805 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNT1P13805 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNT1P13805 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNT1P13805 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNT1P13805 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNNT1P13805 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNNT1P13805 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNNT1P13805 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNNT1P13805 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNNT1P13805 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNNT1P13805 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms