Protein–RNA interactions for Protein: O94906

PRPF6, Pre-mRNA-processing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6O94906 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRPF6O94906 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRPF6O94906 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRPF6O94906 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PRPF6O94906 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRPF6O94906 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRPF6O94906 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRPF6O94906 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRPF6O94906 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRPF6O94906 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF6O94906 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF6O94906 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF6O94906 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF6O94906 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF6O94906 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF6O94906 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF6O94906 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF6O94906 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF6O94906 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF6O94906 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF6O94906 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF6O94906 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRPF6O94906 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRPF6O94906 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRPF6O94906 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRPF6O94906 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRPF6O94906 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PRPF6O94906 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRPF6O94906 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRPF6O94906 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRPF6O94906 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRPF6O94906 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRPF6O94906 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRPF6O94906 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRPF6O94906 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRPF6O94906 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRPF6O94906 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRPF6O94906 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRPF6O94906 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRPF6O94906 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRPF6O94906 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRPF6O94906 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRPF6O94906 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRPF6O94906 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PRPF6O94906 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF6O94906 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF6O94906 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF6O94906 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF6O94906 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF6O94906 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF6O94906 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRPF6O94906 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRPF6O94906 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRPF6O94906 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRPF6O94906 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRPF6O94906 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRPF6O94906 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPF6O94906 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPF6O94906 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPF6O94906 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPF6O94906 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPF6O94906 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRPF6O94906 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PRPF6O94906 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRPF6O94906 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRPF6O94906 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPF6O94906 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPF6O94906 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPF6O94906 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPF6O94906 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPF6O94906 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPF6O94906 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPF6O94906 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRPF6O94906 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRPF6O94906 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRPF6O94906 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRPF6O94906 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRPF6O94906 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRPF6O94906 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PRPF6O94906 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRPF6O94906 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRPF6O94906 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRPF6O94906 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRPF6O94906 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRPF6O94906 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PRPF6O94906 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF6O94906 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF6O94906 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF6O94906 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF6O94906 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF6O94906 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF6O94906 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRPF6O94906 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF6O94906 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF6O94906 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF6O94906 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF6O94906 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPF6O94906 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPF6O94906 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPF6O94906 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms