Protein–RNA interactions for Protein: O43490

PROM1, Prominin-1, humanhuman

Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM1O43490 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PROM1O43490 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PROM1O43490 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PROM1O43490 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PROM1O43490 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PROM1O43490 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PROM1O43490 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PROM1O43490 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PROM1O43490 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PROM1O43490 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PROM1O43490 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PROM1O43490 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PROM1O43490 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PROM1O43490 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PROM1O43490 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PROM1O43490 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PROM1O43490 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PROM1O43490 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PROM1O43490 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PROM1O43490 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PROM1O43490 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PROM1O43490 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PROM1O43490 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PROM1O43490 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PROM1O43490 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PROM1O43490 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PROM1O43490 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PROM1O43490 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PROM1O43490 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PROM1O43490 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PROM1O43490 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PROM1O43490 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PROM1O43490 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PROM1O43490 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PROM1O43490 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROM1O43490 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROM1O43490 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROM1O43490 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROM1O43490 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROM1O43490 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PROM1O43490 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROM1O43490 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROM1O43490 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROM1O43490 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROM1O43490 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROM1O43490 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PROM1O43490 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PROM1O43490 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PROM1O43490 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PROM1O43490 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PROM1O43490 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PROM1O43490 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PROM1O43490 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PROM1O43490 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PROM1O43490 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PROM1O43490 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PROM1O43490 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PROM1O43490 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PROM1O43490 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PROM1O43490 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PROM1O43490 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PROM1O43490 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PROM1O43490 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PROM1O43490 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PROM1O43490 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PROM1O43490 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PROM1O43490 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PROM1O43490 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PROM1O43490 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PROM1O43490 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PROM1O43490 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PROM1O43490 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PROM1O43490 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PROM1O43490 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PROM1O43490 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PROM1O43490 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PROM1O43490 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PROM1O43490 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PROM1O43490 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PROM1O43490 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PROM1O43490 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PROM1O43490 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PROM1O43490 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PROM1O43490 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PROM1O43490 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PROM1O43490 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PROM1O43490 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PROM1O43490 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PROM1O43490 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PROM1O43490 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PROM1O43490 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PROM1O43490 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PROM1O43490 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PROM1O43490 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PROM1O43490 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PROM1O43490 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PROM1O43490 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PROM1O43490 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PROM1O43490 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PROM1O43490 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms