Protein–RNA interactions for Protein: O43490

PROM1, Prominin-1, humanhuman

Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM1O43490 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PROM1O43490 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PROM1O43490 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
PROM1O43490 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PROM1O43490 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PROM1O43490 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PROM1O43490 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PROM1O43490 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PROM1O43490 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
PROM1O43490 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PROM1O43490 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PROM1O43490 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PROM1O43490 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PROM1O43490 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PROM1O43490 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PROM1O43490 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PROM1O43490 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PROM1O43490 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PROM1O43490 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PROM1O43490 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PROM1O43490 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PROM1O43490 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PROM1O43490 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PROM1O43490 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PROM1O43490 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PROM1O43490 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PROM1O43490 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PROM1O43490 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PROM1O43490 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PROM1O43490 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PROM1O43490 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PROM1O43490 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PROM1O43490 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PROM1O43490 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PROM1O43490 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PROM1O43490 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PROM1O43490 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PROM1O43490 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PROM1O43490 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PROM1O43490 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PROM1O43490 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PROM1O43490 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PROM1O43490 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PROM1O43490 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PROM1O43490 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PROM1O43490 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PROM1O43490 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PROM1O43490 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PROM1O43490 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PROM1O43490 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PROM1O43490 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PROM1O43490 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PROM1O43490 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PROM1O43490 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PROM1O43490 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PROM1O43490 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PROM1O43490 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PROM1O43490 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PROM1O43490 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PROM1O43490 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PROM1O43490 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PROM1O43490 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PROM1O43490 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PROM1O43490 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PROM1O43490 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PROM1O43490 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PROM1O43490 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PROM1O43490 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PROM1O43490 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PROM1O43490 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PROM1O43490 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PROM1O43490 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PROM1O43490 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PROM1O43490 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PROM1O43490 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PROM1O43490 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PROM1O43490 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PROM1O43490 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PROM1O43490 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PROM1O43490 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PROM1O43490 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PROM1O43490 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PROM1O43490 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PROM1O43490 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PROM1O43490 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PROM1O43490 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PROM1O43490 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PROM1O43490 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PROM1O43490 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PROM1O43490 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PROM1O43490 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PROM1O43490 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PROM1O43490 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PROM1O43490 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PROM1O43490 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PROM1O43490 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PROM1O43490 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PROM1O43490 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PROM1O43490 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PROM1O43490 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms