Protein–RNA interactions for Protein: O43278

SPINT1, Kunitz-type protease inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINT1O43278 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPINT1O43278 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPINT1O43278 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPINT1O43278 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPINT1O43278 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPINT1O43278 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPINT1O43278 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPINT1O43278 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPINT1O43278 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPINT1O43278 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPINT1O43278 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPINT1O43278 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPINT1O43278 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPINT1O43278 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SPINT1O43278 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPINT1O43278 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPINT1O43278 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPINT1O43278 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPINT1O43278 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPINT1O43278 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPINT1O43278 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPINT1O43278 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPINT1O43278 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPINT1O43278 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPINT1O43278 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPINT1O43278 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPINT1O43278 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPINT1O43278 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPINT1O43278 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPINT1O43278 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPINT1O43278 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPINT1O43278 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPINT1O43278 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPINT1O43278 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPINT1O43278 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPINT1O43278 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPINT1O43278 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPINT1O43278 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPINT1O43278 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPINT1O43278 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPINT1O43278 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPINT1O43278 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPINT1O43278 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPINT1O43278 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPINT1O43278 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPINT1O43278 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPINT1O43278 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPINT1O43278 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPINT1O43278 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPINT1O43278 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPINT1O43278 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPINT1O43278 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPINT1O43278 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPINT1O43278 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPINT1O43278 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPINT1O43278 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPINT1O43278 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPINT1O43278 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPINT1O43278 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPINT1O43278 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPINT1O43278 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPINT1O43278 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPINT1O43278 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPINT1O43278 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPINT1O43278 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPINT1O43278 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPINT1O43278 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPINT1O43278 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPINT1O43278 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPINT1O43278 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPINT1O43278 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPINT1O43278 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPINT1O43278 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPINT1O43278 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPINT1O43278 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPINT1O43278 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SPINT1O43278 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPINT1O43278 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPINT1O43278 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPINT1O43278 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPINT1O43278 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPINT1O43278 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPINT1O43278 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPINT1O43278 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPINT1O43278 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPINT1O43278 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPINT1O43278 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPINT1O43278 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPINT1O43278 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPINT1O43278 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPINT1O43278 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPINT1O43278 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPINT1O43278 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPINT1O43278 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPINT1O43278 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPINT1O43278 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPINT1O43278 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPINT1O43278 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SPINT1O43278 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPINT1O43278 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms