Protein–RNA interactions for Protein: O14787

TNPO2, Transportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO2O14787 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNPO2O14787 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNPO2O14787 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNPO2O14787 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNPO2O14787 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNPO2O14787 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNPO2O14787 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TNPO2O14787 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNPO2O14787 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNPO2O14787 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNPO2O14787 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TNPO2O14787 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNPO2O14787 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNPO2O14787 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNPO2O14787 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNPO2O14787 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNPO2O14787 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNPO2O14787 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNPO2O14787 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNPO2O14787 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNPO2O14787 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNPO2O14787 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TNPO2O14787 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNPO2O14787 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNPO2O14787 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TNPO2O14787 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNPO2O14787 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNPO2O14787 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNPO2O14787 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNPO2O14787 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNPO2O14787 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNPO2O14787 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNPO2O14787 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNPO2O14787 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNPO2O14787 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNPO2O14787 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNPO2O14787 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNPO2O14787 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNPO2O14787 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNPO2O14787 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNPO2O14787 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNPO2O14787 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNPO2O14787 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNPO2O14787 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
TNPO2O14787 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNPO2O14787 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNPO2O14787 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNPO2O14787 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TNPO2O14787 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNPO2O14787 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNPO2O14787 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNPO2O14787 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNPO2O14787 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNPO2O14787 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TNPO2O14787 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNPO2O14787 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNPO2O14787 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNPO2O14787 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TNPO2O14787 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNPO2O14787 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNPO2O14787 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNPO2O14787 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNPO2O14787 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNPO2O14787 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNPO2O14787 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNPO2O14787 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNPO2O14787 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNPO2O14787 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNPO2O14787 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNPO2O14787 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNPO2O14787 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNPO2O14787 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TNPO2O14787 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNPO2O14787 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNPO2O14787 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNPO2O14787 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNPO2O14787 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNPO2O14787 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNPO2O14787 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNPO2O14787 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNPO2O14787 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNPO2O14787 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNPO2O14787 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TNPO2O14787 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TNPO2O14787 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNPO2O14787 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNPO2O14787 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNPO2O14787 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNPO2O14787 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNPO2O14787 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNPO2O14787 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNPO2O14787 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNPO2O14787 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNPO2O14787 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNPO2O14787 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNPO2O14787 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNPO2O14787 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNPO2O14787 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNPO2O14787 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNPO2O14787 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms