Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PTPDC1A2A3K4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPDC1A2A3K4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPDC1A2A3K4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPDC1A2A3K4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPDC1A2A3K4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPDC1A2A3K4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPDC1A2A3K4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPDC1A2A3K4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPDC1A2A3K4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPDC1A2A3K4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPDC1A2A3K4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPDC1A2A3K4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPDC1A2A3K4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPDC1A2A3K4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPDC1A2A3K4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPDC1A2A3K4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPDC1A2A3K4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPDC1A2A3K4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPDC1A2A3K4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPDC1A2A3K4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPDC1A2A3K4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPDC1A2A3K4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPDC1A2A3K4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPDC1A2A3K4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPDC1A2A3K4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPDC1A2A3K4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPDC1A2A3K4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPDC1A2A3K4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPDC1A2A3K4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PTPDC1A2A3K4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPDC1A2A3K4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPDC1A2A3K4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPDC1A2A3K4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPDC1A2A3K4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPDC1A2A3K4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPDC1A2A3K4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPDC1A2A3K4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPDC1A2A3K4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPDC1A2A3K4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPDC1A2A3K4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPDC1A2A3K4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPDC1A2A3K4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPDC1A2A3K4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPDC1A2A3K4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPDC1A2A3K4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPDC1A2A3K4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPDC1A2A3K4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPDC1A2A3K4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPDC1A2A3K4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPDC1A2A3K4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPDC1A2A3K4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPDC1A2A3K4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPDC1A2A3K4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPDC1A2A3K4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPDC1A2A3K4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPDC1A2A3K4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPDC1A2A3K4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPDC1A2A3K4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPDC1A2A3K4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPDC1A2A3K4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPDC1A2A3K4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPDC1A2A3K4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPDC1A2A3K4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPDC1A2A3K4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPDC1A2A3K4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPDC1A2A3K4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPDC1A2A3K4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPDC1A2A3K4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPDC1A2A3K4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPDC1A2A3K4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPDC1A2A3K4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPDC1A2A3K4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPDC1A2A3K4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPDC1A2A3K4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPDC1A2A3K4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPDC1A2A3K4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPDC1A2A3K4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPDC1A2A3K4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPDC1A2A3K4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPDC1A2A3K4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPDC1A2A3K4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPDC1A2A3K4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPDC1A2A3K4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPDC1A2A3K4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPDC1A2A3K4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPDC1A2A3K4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPDC1A2A3K4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPDC1A2A3K4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPDC1A2A3K4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPDC1A2A3K4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPDC1A2A3K4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPDC1A2A3K4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPDC1A2A3K4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPDC1A2A3K4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PTPDC1A2A3K4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPDC1A2A3K4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPDC1A2A3K4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPDC1A2A3K4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPDC1A2A3K4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms