Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL4Q9BPW4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL4Q9BPW4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL4Q9BPW4 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL4Q9BPW4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL4Q9BPW4 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL4Q9BPW4 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL4Q9BPW4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL4Q9BPW4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL4Q9BPW4 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL4Q9BPW4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL4Q9BPW4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL4Q9BPW4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL4Q9BPW4 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL4Q9BPW4 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL4Q9BPW4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL4Q9BPW4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL4Q9BPW4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL4Q9BPW4 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms