Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms