Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOEP02649 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOEP02649 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOEP02649 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOEP02649 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOEP02649 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOEP02649 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOEP02649 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
APOEP02649 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
APOEP02649 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOEP02649 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOEP02649 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOEP02649 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOEP02649 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOEP02649 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOEP02649 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOEP02649 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOEP02649 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOEP02649 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOEP02649 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOEP02649 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOEP02649 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOEP02649 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOEP02649 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOEP02649 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOEP02649 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOEP02649 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOEP02649 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOEP02649 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOEP02649 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOEP02649 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOEP02649 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOEP02649 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOEP02649 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOEP02649 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOEP02649 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
APOEP02649 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOEP02649 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOEP02649 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
APOEP02649 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
APOEP02649 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOEP02649 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOEP02649 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOEP02649 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOEP02649 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOEP02649 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOEP02649 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
APOEP02649 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOEP02649 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOEP02649 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOEP02649 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOEP02649 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOEP02649 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOEP02649 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOEP02649 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOEP02649 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOEP02649 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOEP02649 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOEP02649 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOEP02649 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOEP02649 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOEP02649 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOEP02649 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOEP02649 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOEP02649 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOEP02649 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOEP02649 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APOEP02649 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOEP02649 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOEP02649 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOEP02649 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOEP02649 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOEP02649 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOEP02649 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APOEP02649 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APOEP02649 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APOEP02649 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOEP02649 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOEP02649 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOEP02649 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOEP02649 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOEP02649 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOEP02649 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOEP02649 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOEP02649 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOEP02649 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOEP02649 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOEP02649 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOEP02649 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOEP02649 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOEP02649 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOEP02649 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOEP02649 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOEP02649 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOEP02649 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOEP02649 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOEP02649 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOEP02649 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOEP02649 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOEP02649 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms