Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms