Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELF3P78545 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELF3P78545 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELF3P78545 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELF3P78545 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELF3P78545 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELF3P78545 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ELF3P78545 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELF3P78545 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ELF3P78545 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ELF3P78545 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ELF3P78545 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ELF3P78545 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ELF3P78545 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ELF3P78545 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELF3P78545 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELF3P78545 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELF3P78545 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELF3P78545 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELF3P78545 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELF3P78545 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELF3P78545 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELF3P78545 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ELF3P78545 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ELF3P78545 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELF3P78545 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELF3P78545 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELF3P78545 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELF3P78545 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELF3P78545 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ELF3P78545 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELF3P78545 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELF3P78545 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELF3P78545 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELF3P78545 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELF3P78545 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELF3P78545 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELF3P78545 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELF3P78545 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELF3P78545 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELF3P78545 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELF3P78545 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELF3P78545 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELF3P78545 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELF3P78545 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELF3P78545 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELF3P78545 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELF3P78545 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELF3P78545 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELF3P78545 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELF3P78545 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELF3P78545 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELF3P78545 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELF3P78545 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ELF3P78545 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELF3P78545 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELF3P78545 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELF3P78545 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELF3P78545 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELF3P78545 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELF3P78545 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELF3P78545 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELF3P78545 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELF3P78545 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELF3P78545 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELF3P78545 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELF3P78545 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ELF3P78545 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ELF3P78545 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELF3P78545 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELF3P78545 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELF3P78545 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELF3P78545 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELF3P78545 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELF3P78545 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELF3P78545 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELF3P78545 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELF3P78545 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELF3P78545 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELF3P78545 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELF3P78545 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELF3P78545 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ELF3P78545 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ELF3P78545 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ELF3P78545 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ELF3P78545 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ELF3P78545 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ELF3P78545 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ELF3P78545 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ELF3P78545 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ELF3P78545 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ELF3P78545 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ELF3P78545 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ELF3P78545 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ELF3P78545 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ELF3P78545 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ELF3P78545 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ELF3P78545 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ELF3P78545 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ELF3P78545 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms