Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms