Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms