Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms