Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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