Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms