Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3D2

MSRB2, Methionine-R-sulfoxide reductase B2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB2Q9Y3D2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSRB2Q9Y3D2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSRB2Q9Y3D2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSRB2Q9Y3D2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSRB2Q9Y3D2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MSRB2Q9Y3D2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSRB2Q9Y3D2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MSRB2Q9Y3D2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MSRB2Q9Y3D2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MSRB2Q9Y3D2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MSRB2Q9Y3D2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSRB2Q9Y3D2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSRB2Q9Y3D2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSRB2Q9Y3D2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MSRB2Q9Y3D2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSRB2Q9Y3D2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSRB2Q9Y3D2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MSRB2Q9Y3D2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSRB2Q9Y3D2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSRB2Q9Y3D2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSRB2Q9Y3D2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSRB2Q9Y3D2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSRB2Q9Y3D2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSRB2Q9Y3D2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MSRB2Q9Y3D2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MSRB2Q9Y3D2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSRB2Q9Y3D2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSRB2Q9Y3D2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSRB2Q9Y3D2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSRB2Q9Y3D2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSRB2Q9Y3D2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSRB2Q9Y3D2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSRB2Q9Y3D2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSRB2Q9Y3D2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MSRB2Q9Y3D2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSRB2Q9Y3D2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSRB2Q9Y3D2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSRB2Q9Y3D2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSRB2Q9Y3D2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSRB2Q9Y3D2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSRB2Q9Y3D2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSRB2Q9Y3D2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSRB2Q9Y3D2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSRB2Q9Y3D2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSRB2Q9Y3D2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSRB2Q9Y3D2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSRB2Q9Y3D2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSRB2Q9Y3D2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSRB2Q9Y3D2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSRB2Q9Y3D2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSRB2Q9Y3D2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSRB2Q9Y3D2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MSRB2Q9Y3D2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSRB2Q9Y3D2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSRB2Q9Y3D2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSRB2Q9Y3D2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSRB2Q9Y3D2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSRB2Q9Y3D2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSRB2Q9Y3D2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSRB2Q9Y3D2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSRB2Q9Y3D2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSRB2Q9Y3D2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSRB2Q9Y3D2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSRB2Q9Y3D2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSRB2Q9Y3D2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSRB2Q9Y3D2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSRB2Q9Y3D2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSRB2Q9Y3D2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSRB2Q9Y3D2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSRB2Q9Y3D2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MSRB2Q9Y3D2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSRB2Q9Y3D2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MSRB2Q9Y3D2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSRB2Q9Y3D2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSRB2Q9Y3D2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSRB2Q9Y3D2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSRB2Q9Y3D2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSRB2Q9Y3D2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MSRB2Q9Y3D2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSRB2Q9Y3D2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSRB2Q9Y3D2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSRB2Q9Y3D2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSRB2Q9Y3D2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSRB2Q9Y3D2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSRB2Q9Y3D2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSRB2Q9Y3D2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MSRB2Q9Y3D2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSRB2Q9Y3D2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSRB2Q9Y3D2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSRB2Q9Y3D2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MSRB2Q9Y3D2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSRB2Q9Y3D2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MSRB2Q9Y3D2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSRB2Q9Y3D2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSRB2Q9Y3D2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSRB2Q9Y3D2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSRB2Q9Y3D2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSRB2Q9Y3D2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MSRB2Q9Y3D2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MSRB2Q9Y3D2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms