Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SHANK2Q9UPX8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SHANK2Q9UPX8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
SHANK2Q9UPX8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
SHANK2Q9UPX8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
SHANK2Q9UPX8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
SHANK2Q9UPX8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
SHANK2Q9UPX8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
SHANK2Q9UPX8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
SHANK2Q9UPX8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
SHANK2Q9UPX8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
SHANK2Q9UPX8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
SHANK2Q9UPX8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.54
SHANK2Q9UPX8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
SHANK2Q9UPX8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
SHANK2Q9UPX8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
SHANK2Q9UPX8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
SHANK2Q9UPX8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
SHANK2Q9UPX8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
SHANK2Q9UPX8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
SHANK2Q9UPX8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
SHANK2Q9UPX8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
SHANK2Q9UPX8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
SHANK2Q9UPX8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
SHANK2Q9UPX8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
SHANK2Q9UPX8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
SHANK2Q9UPX8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
SHANK2Q9UPX8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
SHANK2Q9UPX8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
SHANK2Q9UPX8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
SHANK2Q9UPX8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
SHANK2Q9UPX8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
SHANK2Q9UPX8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
SHANK2Q9UPX8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
SHANK2Q9UPX8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
SHANK2Q9UPX8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
SHANK2Q9UPX8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
SHANK2Q9UPX8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
SHANK2Q9UPX8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
SHANK2Q9UPX8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
SHANK2Q9UPX8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
SHANK2Q9UPX8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SHANK2Q9UPX8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SHANK2Q9UPX8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SHANK2Q9UPX8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SHANK2Q9UPX8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
SHANK2Q9UPX8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SHANK2Q9UPX8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
SHANK2Q9UPX8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC37.05■■■■□ 3.52
SHANK2Q9UPX8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
SHANK2Q9UPX8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
SHANK2Q9UPX8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SHANK2Q9UPX8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SHANK2Q9UPX8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SHANK2Q9UPX8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SHANK2Q9UPX8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
SHANK2Q9UPX8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
SHANK2Q9UPX8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
SHANK2Q9UPX8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
SHANK2Q9UPX8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
SHANK2Q9UPX8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
SHANK2Q9UPX8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
SHANK2Q9UPX8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
SHANK2Q9UPX8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
SHANK2Q9UPX8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
SHANK2Q9UPX8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
SHANK2Q9UPX8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
SHANK2Q9UPX8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
SHANK2Q9UPX8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
SHANK2Q9UPX8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
SHANK2Q9UPX8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
SHANK2Q9UPX8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
SHANK2Q9UPX8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
SHANK2Q9UPX8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
SHANK2Q9UPX8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
SHANK2Q9UPX8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
SHANK2Q9UPX8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
SHANK2Q9UPX8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
SHANK2Q9UPX8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
SHANK2Q9UPX8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
SHANK2Q9UPX8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
SHANK2Q9UPX8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
SHANK2Q9UPX8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
SHANK2Q9UPX8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
SHANK2Q9UPX8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
SHANK2Q9UPX8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
SHANK2Q9UPX8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC36.94■■■■□ 3.5
SHANK2Q9UPX8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
SHANK2Q9UPX8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
SHANK2Q9UPX8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
SHANK2Q9UPX8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
SHANK2Q9UPX8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
SHANK2Q9UPX8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
SHANK2Q9UPX8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
SHANK2Q9UPX8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
SHANK2Q9UPX8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
SHANK2Q9UPX8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
SHANK2Q9UPX8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC36.93■■■■□ 3.5
SHANK2Q9UPX8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
SHANK2Q9UPX8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms