Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNN4

GTF2A1L, TFIIA-alpha and beta-like factor, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1LQ9UNN4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2A1LQ9UNN4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2A1LQ9UNN4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2A1LQ9UNN4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2A1LQ9UNN4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2A1LQ9UNN4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2A1LQ9UNN4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2A1LQ9UNN4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2A1LQ9UNN4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2A1LQ9UNN4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2A1LQ9UNN4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2A1LQ9UNN4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2A1LQ9UNN4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2A1LQ9UNN4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2A1LQ9UNN4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2A1LQ9UNN4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2A1LQ9UNN4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2A1LQ9UNN4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2A1LQ9UNN4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2A1LQ9UNN4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2A1LQ9UNN4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2A1LQ9UNN4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2A1LQ9UNN4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2A1LQ9UNN4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2A1LQ9UNN4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2A1LQ9UNN4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2A1LQ9UNN4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2A1LQ9UNN4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2A1LQ9UNN4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2A1LQ9UNN4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2A1LQ9UNN4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2A1LQ9UNN4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2A1LQ9UNN4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2A1LQ9UNN4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2A1LQ9UNN4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2A1LQ9UNN4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2A1LQ9UNN4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2A1LQ9UNN4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2A1LQ9UNN4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2A1LQ9UNN4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2A1LQ9UNN4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2A1LQ9UNN4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2A1LQ9UNN4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2A1LQ9UNN4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2A1LQ9UNN4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2A1LQ9UNN4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2A1LQ9UNN4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2A1LQ9UNN4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A1LQ9UNN4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A1LQ9UNN4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A1LQ9UNN4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A1LQ9UNN4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A1LQ9UNN4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A1LQ9UNN4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2A1LQ9UNN4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2A1LQ9UNN4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2A1LQ9UNN4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2A1LQ9UNN4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2A1LQ9UNN4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2A1LQ9UNN4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2A1LQ9UNN4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2A1LQ9UNN4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2A1LQ9UNN4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2A1LQ9UNN4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2A1LQ9UNN4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2A1LQ9UNN4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2A1LQ9UNN4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2A1LQ9UNN4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2A1LQ9UNN4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2A1LQ9UNN4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2A1LQ9UNN4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2A1LQ9UNN4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2A1LQ9UNN4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2A1LQ9UNN4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2A1LQ9UNN4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2A1LQ9UNN4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2A1LQ9UNN4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2A1LQ9UNN4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2A1LQ9UNN4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2A1LQ9UNN4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GTF2A1LQ9UNN4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2A1LQ9UNN4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2A1LQ9UNN4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2A1LQ9UNN4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2A1LQ9UNN4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2A1LQ9UNN4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2A1LQ9UNN4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2A1LQ9UNN4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2A1LQ9UNN4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2A1LQ9UNN4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2A1LQ9UNN4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2A1LQ9UNN4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2A1LQ9UNN4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2A1LQ9UNN4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2A1LQ9UNN4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2A1LQ9UNN4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2A1LQ9UNN4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2A1LQ9UNN4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2A1LQ9UNN4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2A1LQ9UNN4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms