Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FBXO40Q9UH90 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FBXO40Q9UH90 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FBXO40Q9UH90 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FBXO40Q9UH90 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FBXO40Q9UH90 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FBXO40Q9UH90 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FBXO40Q9UH90 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FBXO40Q9UH90 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FBXO40Q9UH90 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FBXO40Q9UH90 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FBXO40Q9UH90 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FBXO40Q9UH90 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FBXO40Q9UH90 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FBXO40Q9UH90 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FBXO40Q9UH90 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
FBXO40Q9UH90 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FBXO40Q9UH90 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FBXO40Q9UH90 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FBXO40Q9UH90 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FBXO40Q9UH90 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FBXO40Q9UH90 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FBXO40Q9UH90 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FBXO40Q9UH90 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FBXO40Q9UH90 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FBXO40Q9UH90 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FBXO40Q9UH90 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
FBXO40Q9UH90 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FBXO40Q9UH90 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FBXO40Q9UH90 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FBXO40Q9UH90 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FBXO40Q9UH90 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FBXO40Q9UH90 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FBXO40Q9UH90 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FBXO40Q9UH90 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FBXO40Q9UH90 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FBXO40Q9UH90 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FBXO40Q9UH90 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FBXO40Q9UH90 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FBXO40Q9UH90 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FBXO40Q9UH90 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FBXO40Q9UH90 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FBXO40Q9UH90 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FBXO40Q9UH90 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FBXO40Q9UH90 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FBXO40Q9UH90 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FBXO40Q9UH90 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FBXO40Q9UH90 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FBXO40Q9UH90 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FBXO40Q9UH90 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FBXO40Q9UH90 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FBXO40Q9UH90 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FBXO40Q9UH90 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FBXO40Q9UH90 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FBXO40Q9UH90 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
FBXO40Q9UH90 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FBXO40Q9UH90 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FBXO40Q9UH90 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FBXO40Q9UH90 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FBXO40Q9UH90 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FBXO40Q9UH90 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FBXO40Q9UH90 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FBXO40Q9UH90 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FBXO40Q9UH90 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
FBXO40Q9UH90 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
FBXO40Q9UH90 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FBXO40Q9UH90 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FBXO40Q9UH90 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FBXO40Q9UH90 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FBXO40Q9UH90 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FBXO40Q9UH90 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FBXO40Q9UH90 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FBXO40Q9UH90 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FBXO40Q9UH90 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
FBXO40Q9UH90 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FBXO40Q9UH90 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FBXO40Q9UH90 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FBXO40Q9UH90 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FBXO40Q9UH90 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FBXO40Q9UH90 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FBXO40Q9UH90 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
FBXO40Q9UH90 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FBXO40Q9UH90 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
FBXO40Q9UH90 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FBXO40Q9UH90 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FBXO40Q9UH90 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FBXO40Q9UH90 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FBXO40Q9UH90 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FBXO40Q9UH90 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FBXO40Q9UH90 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FBXO40Q9UH90 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FBXO40Q9UH90 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FBXO40Q9UH90 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FBXO40Q9UH90 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FBXO40Q9UH90 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FBXO40Q9UH90 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FBXO40Q9UH90 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FBXO40Q9UH90 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FBXO40Q9UH90 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FBXO40Q9UH90 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms