Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOR4AQ9NXH8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOR4AQ9NXH8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TOR4AQ9NXH8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOR4AQ9NXH8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TOR4AQ9NXH8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TOR4AQ9NXH8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TOR4AQ9NXH8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOR4AQ9NXH8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOR4AQ9NXH8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TOR4AQ9NXH8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOR4AQ9NXH8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOR4AQ9NXH8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TOR4AQ9NXH8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TOR4AQ9NXH8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOR4AQ9NXH8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOR4AQ9NXH8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOR4AQ9NXH8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOR4AQ9NXH8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOR4AQ9NXH8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOR4AQ9NXH8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOR4AQ9NXH8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOR4AQ9NXH8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOR4AQ9NXH8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOR4AQ9NXH8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOR4AQ9NXH8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOR4AQ9NXH8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOR4AQ9NXH8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOR4AQ9NXH8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOR4AQ9NXH8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOR4AQ9NXH8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOR4AQ9NXH8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOR4AQ9NXH8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TOR4AQ9NXH8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TOR4AQ9NXH8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOR4AQ9NXH8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOR4AQ9NXH8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOR4AQ9NXH8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOR4AQ9NXH8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOR4AQ9NXH8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOR4AQ9NXH8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOR4AQ9NXH8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOR4AQ9NXH8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TOR4AQ9NXH8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TOR4AQ9NXH8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOR4AQ9NXH8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOR4AQ9NXH8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOR4AQ9NXH8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOR4AQ9NXH8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOR4AQ9NXH8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOR4AQ9NXH8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOR4AQ9NXH8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOR4AQ9NXH8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOR4AQ9NXH8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOR4AQ9NXH8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOR4AQ9NXH8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOR4AQ9NXH8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOR4AQ9NXH8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOR4AQ9NXH8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOR4AQ9NXH8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOR4AQ9NXH8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOR4AQ9NXH8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOR4AQ9NXH8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOR4AQ9NXH8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOR4AQ9NXH8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOR4AQ9NXH8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOR4AQ9NXH8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOR4AQ9NXH8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOR4AQ9NXH8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOR4AQ9NXH8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOR4AQ9NXH8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TOR4AQ9NXH8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOR4AQ9NXH8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOR4AQ9NXH8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOR4AQ9NXH8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOR4AQ9NXH8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOR4AQ9NXH8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOR4AQ9NXH8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOR4AQ9NXH8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOR4AQ9NXH8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TOR4AQ9NXH8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TOR4AQ9NXH8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TOR4AQ9NXH8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TOR4AQ9NXH8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TOR4AQ9NXH8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TOR4AQ9NXH8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TOR4AQ9NXH8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TOR4AQ9NXH8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOR4AQ9NXH8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOR4AQ9NXH8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TOR4AQ9NXH8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOR4AQ9NXH8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOR4AQ9NXH8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOR4AQ9NXH8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOR4AQ9NXH8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOR4AQ9NXH8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOR4AQ9NXH8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOR4AQ9NXH8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOR4AQ9NXH8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOR4AQ9NXH8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms