Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GINM1Q9NU53 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GINM1Q9NU53 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GINM1Q9NU53 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GINM1Q9NU53 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GINM1Q9NU53 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GINM1Q9NU53 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GINM1Q9NU53 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GINM1Q9NU53 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GINM1Q9NU53 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GINM1Q9NU53 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GINM1Q9NU53 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GINM1Q9NU53 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GINM1Q9NU53 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
GINM1Q9NU53 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GINM1Q9NU53 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GINM1Q9NU53 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GINM1Q9NU53 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GINM1Q9NU53 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GINM1Q9NU53 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GINM1Q9NU53 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GINM1Q9NU53 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GINM1Q9NU53 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GINM1Q9NU53 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GINM1Q9NU53 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GINM1Q9NU53 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
GINM1Q9NU53 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GINM1Q9NU53 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GINM1Q9NU53 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GINM1Q9NU53 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
GINM1Q9NU53 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GINM1Q9NU53 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GINM1Q9NU53 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GINM1Q9NU53 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GINM1Q9NU53 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GINM1Q9NU53 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GINM1Q9NU53 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GINM1Q9NU53 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GINM1Q9NU53 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GINM1Q9NU53 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GINM1Q9NU53 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GINM1Q9NU53 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GINM1Q9NU53 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GINM1Q9NU53 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GINM1Q9NU53 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GINM1Q9NU53 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GINM1Q9NU53 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GINM1Q9NU53 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GINM1Q9NU53 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GINM1Q9NU53 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GINM1Q9NU53 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GINM1Q9NU53 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GINM1Q9NU53 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GINM1Q9NU53 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GINM1Q9NU53 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GINM1Q9NU53 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GINM1Q9NU53 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
GINM1Q9NU53 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GINM1Q9NU53 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GINM1Q9NU53 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
GINM1Q9NU53 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GINM1Q9NU53 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GINM1Q9NU53 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
GINM1Q9NU53 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GINM1Q9NU53 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GINM1Q9NU53 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GINM1Q9NU53 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
GINM1Q9NU53 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GINM1Q9NU53 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GINM1Q9NU53 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GINM1Q9NU53 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
GINM1Q9NU53 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GINM1Q9NU53 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GINM1Q9NU53 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GINM1Q9NU53 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GINM1Q9NU53 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GINM1Q9NU53 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GINM1Q9NU53 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GINM1Q9NU53 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GINM1Q9NU53 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GINM1Q9NU53 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GINM1Q9NU53 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GINM1Q9NU53 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GINM1Q9NU53 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GINM1Q9NU53 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GINM1Q9NU53 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GINM1Q9NU53 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GINM1Q9NU53 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GINM1Q9NU53 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
GINM1Q9NU53 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
GINM1Q9NU53 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GINM1Q9NU53 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GINM1Q9NU53 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GINM1Q9NU53 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GINM1Q9NU53 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GINM1Q9NU53 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GINM1Q9NU53 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
GINM1Q9NU53 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GINM1Q9NU53 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GINM1Q9NU53 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms