Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 GATD1-212ENST00000530209 600 ntTSL 421.66■■□□□ 1.065e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.065e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TNFAIP2-207ENST00000560562 1429 ntTSL 1 (best)21.65■■□□□ 1.065e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.035e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 SCRN2-206ENST00000580428 717 ntTSL 221.49■■□□□ 1.035e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TSPAN4-220ENST00000532375 518 ntTSL 521.48■■□□□ 1.034e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ACSF2-220ENST00000511288 838 ntTSL 1 (best)21.46■■□□□ 1.035e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 B3GNTL1-206ENST00000571954 881 ntTSL 521.45■■□□□ 1.025e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.025e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.995e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TSTA3-209ENST00000529048 869 ntTSL 521.19■□□□□ 0.985e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 SRPK2-203ENST00000460391 666 ntTSL 221.08■□□□□ 0.965e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 PRPF8-202ENST00000571346 865 ntTSL 221.08■□□□□ 0.965e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ACSF2-205ENST00000503387 559 ntTSL 420.97■□□□□ 0.955e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TBKBP1-202ENST00000537587 705 ntTSL 320.94■□□□□ 0.941e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.945e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ECH1-204ENST00000595470 560 ntTSL 220.85■□□□□ 0.935e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.915e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.892e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ACSF2-215ENST00000508734 165 ntTSL 520.55■□□□□ 0.885e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TNFAIP2-208ENST00000560670 1334 ntTSL 220.53■□□□□ 0.885e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 DEAF1-205ENST00000526790 498 ntTSL 220.47■□□□□ 0.875e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TIA1-210ENST00000474809 915 ntTSL 520.4■□□□□ 0.865e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.845e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.845e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.845e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.835e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.825e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.825e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ERI3-207ENST00000479101 367 ntTSL 320.13■□□□□ 0.815e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ECH1-202ENST00000594164 677 ntTSL 320.11■□□□□ 0.815e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ERI3-204ENST00000456170 1103 ntTSL 520.09■□□□□ 0.815e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 PRPF8-216ENST00000577001 3274 ntTSL 520.08■□□□□ 0.815e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.85e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.85e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 MPRIP-219ENST00000584067 3195 ntTSL 1 (best)20.02■□□□□ 0.82e-7■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 SAP130-204ENST00000424298 849 ntTSL 220■□□□□ 0.795e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.795e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TSTA3-212ENST00000530474 823 ntTSL 519.95■□□□□ 0.785e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 DEAF1-204ENST00000525904 797 ntTSL 319.91■□□□□ 0.785e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 DEAF1-212ENST00000530813 668 ntTSL 519.91■□□□□ 0.785e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 MINK1-209ENST00000574453 4941 ntTSL 1 (best)19.85■□□□□ 0.775e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.775e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.765e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.755e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 MRPL49-202ENST00000524482 2065 ntTSL 219.67■□□□□ 0.745e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 MEGF6-205ENST00000485002 4705 ntTSL 519.56■□□□□ 0.726e-7■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ECH1-201ENST00000221418 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.75e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.75e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ARHGAP17-217ENST00000575447 559 ntTSL 219.43■□□□□ 0.75e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.75e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.695e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.685e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TSTA3-210ENST00000529064 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.675e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 AC008982.1-201ENST00000594769 963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.665e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ACSF2-214ENST00000508245 665 ntTSL 519.16■□□□□ 0.665e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.655e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.625e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 SRPK2-204ENST00000462282 505 ntTSL 318.84■□□□□ 0.615e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 BRF1-222ENST00000635152 2876 ntTSL 218.83■□□□□ 0.615e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 BRD1-204ENST00000438393 3051 ntTSL 218.83■□□□□ 0.65e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.595e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 MINK1-207ENST00000572330 5299 ntTSL 518.71■□□□□ 0.595e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 APH1A-205ENST00000461320 1038 ntTSL 318.64■□□□□ 0.575e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.565e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.555e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 MPRIP-201ENST00000313485 6050 ntTSL 518.39■□□□□ 0.542e-7■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ACSF2-216ENST00000509806 706 ntTSL 317.91■□□□□ 0.465e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.452e-7■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ACSF2-210ENST00000506085 864 ntTSL 1 (best)17.8■□□□□ 0.445e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 AC099489.1-207ENST00000595170 3552 ntTSL 217.8■□□□□ 0.445e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ECH1-210ENST00000598316 553 ntTSL 217.79■□□□□ 0.445e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 USP36-223ENST00000592326 406 ntTSL 517.79■□□□□ 0.445e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 PPP1CA-206ENST00000529724 572 ntTSL 217.73■□□□□ 0.435e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.435e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 SMG9-206ENST00000597598 1077 ntTSL 517.62■□□□□ 0.415e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 NBEAL2-201ENST00000416683 6364 ntTSL 1 (best)17.46■□□□□ 0.395e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 MINK1-204ENST00000571207 4569 ntTSL 517.45■□□□□ 0.385e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 BRF1-210ENST00000547374 3809 ntTSL 517.45■□□□□ 0.385e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 MXD4-203ENST00000513372 4228 ntTSL 217.36■□□□□ 0.375e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 B3GNTL1-202ENST00000570947 390 ntTSL 317.19■□□□□ 0.345e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 MPRIP-215ENST00000579832 438 ntTSL 317.05■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 SERPINH1-202ENST00000524558 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.325e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 PAPLN-201ENST00000216658 4182 ntTSL 1 (best)17.04■□□□□ 0.325e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.325e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ARHGAP17-202ENST00000303665 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.255e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 PPP1CA-205ENST00000527663 765 ntTSL 316.58■□□□□ 0.245e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 MINK1-210ENST00000574871 3150 ntTSL 216.53■□□□□ 0.245e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.231e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TBC1D9B-219ENST00000524222 927 ntTSL 516.43■□□□□ 0.225e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 G3BP2-208ENST00000507252 567 ntTSL 416.39■□□□□ 0.215e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 CMIP-211ENST00000621537 4000 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.194e-11■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.185e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ARHGAP17-201ENST00000289968 3461 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.175e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 PAPLN-203ENST00000554301 4090 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.155e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 PAPLN-208ENST00000555445 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.125e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 SLC45A4-201ENST00000024061 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.115e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 SH3D21-204ENST00000496636 383 ntTSL 315.75■□□□□ 0.115e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 SLC45A4-202ENST00000517878 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.095e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 BRD1-202ENST00000404034 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.085e-6■■■■■ 46.2
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