RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529048.5

TSTA3-209, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 869 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-209ENST00000529048 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.84■■■■□ 3.01
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TSTA3-209ENST00000529048 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.45■■■□□ 2.14
TSTA3-209ENST00000529048 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.36■■■□□ 2.13
TSTA3-209ENST00000529048 NACADO15069 1562 aa28.28■■■□□ 2.12
TSTA3-209ENST00000529048 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
TSTA3-209ENST00000529048 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.99■■■□□ 2.07
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TSTA3-209ENST00000529048 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.85■■■□□ 2.05
TSTA3-209ENST00000529048 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.7■■■□□ 2.026e-9■□□□□ 10.6
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TSTA3-209ENST00000529048 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.06■■□□□ 1.92
TSTA3-209ENST00000529048 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
TSTA3-209ENST00000529048 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.76■■□□□ 1.87
TSTA3-209ENST00000529048 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.56■■□□□ 1.84
TSTA3-209ENST00000529048 SMARCA4P51532 1647 aa26.3■■□□□ 1.8
TSTA3-209ENST00000529048 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.79
TSTA3-209ENST00000529048 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.15■■□□□ 1.78
TSTA3-209ENST00000529048 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.14■■□□□ 1.78
TSTA3-209ENST00000529048 NCAPD3P42695 1498 aa26.09■■□□□ 1.77
TSTA3-209ENST00000529048 SMARCA2P51531 1590 aa26.07■■□□□ 1.76
TSTA3-209ENST00000529048 HMGXB3Q12766 1538 aa25.96■■□□□ 1.75
TSTA3-209ENST00000529048 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.95■■□□□ 1.75
TSTA3-209ENST00000529048 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
TSTA3-209ENST00000529048 WIZO95785 1651 aa25.9■■□□□ 1.74
TSTA3-209ENST00000529048 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
TSTA3-209ENST00000529048 NESP48681 1621 aa25.63■■□□□ 1.69
TSTA3-209ENST00000529048 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
TSTA3-209ENST00000529048 ERCC6Q03468 1493 aa25.49■■□□□ 1.67
TSTA3-209ENST00000529048 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.44■■□□□ 1.66
TSTA3-209ENST00000529048 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.35■■□□□ 1.65
TSTA3-209ENST00000529048 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.33■■□□□ 1.65
TSTA3-209ENST00000529048 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.26■■□□□ 1.63
TSTA3-209ENST00000529048 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.25■■□□□ 1.63
TSTA3-209ENST00000529048 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
TSTA3-209ENST00000529048 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
TSTA3-209ENST00000529048 CFTRP13569 1480 aa25.18■■□□□ 1.62
TSTA3-209ENST00000529048 CUX2O14529 1486 aa25.15■■□□□ 1.62
TSTA3-209ENST00000529048 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.1■■□□□ 1.61
TSTA3-209ENST00000529048 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.07■■□□□ 1.6
TSTA3-209ENST00000529048 PRDM2Q13029 1718 aa25.06■■□□□ 1.6
TSTA3-209ENST00000529048 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.04■■□□□ 1.6
TSTA3-209ENST00000529048 WDR62O43379 1518 aa24.95■■□□□ 1.58
TSTA3-209ENST00000529048 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
TSTA3-209ENST00000529048 TOPBP1Q92547 1522 aa24.7■■□□□ 1.54
TSTA3-209ENST00000529048 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.65■■□□□ 1.54
TSTA3-209ENST00000529048 ABCC8Q09428 1581 aa24.59■■□□□ 1.53
TSTA3-209ENST00000529048 CUX1P39880 1505 aa24.51■■□□□ 1.51
TSTA3-209ENST00000529048 IFT140Q96RY7 1462 aa24.51■■□□□ 1.51
TSTA3-209ENST00000529048 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
TSTA3-209ENST00000529048 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.5■■□□□ 1.51
TSTA3-209ENST00000529048 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
TSTA3-209ENST00000529048 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.45■■□□□ 1.5
TSTA3-209ENST00000529048 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
TSTA3-209ENST00000529048 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.44■■□□□ 1.5
TSTA3-209ENST00000529048 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
TSTA3-209ENST00000529048 SOGA1O94964 1423 aa24.38■■□□□ 1.49
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TSTA3-209ENST00000529048 SYNJ1O43426 1573 aa24.31■■□□□ 1.48
TSTA3-209ENST00000529048 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.3■■□□□ 1.48
TSTA3-209ENST00000529048 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
TSTA3-209ENST00000529048 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.26■■□□□ 1.47
TSTA3-209ENST00000529048 TOP2BQ02880 1626 aa24.25■■□□□ 1.47
TSTA3-209ENST00000529048 WDR97A6NE52 1622 aa24.24■■□□□ 1.47
TSTA3-209ENST00000529048 CHD1O14646 1710 aa24.14■■□□□ 1.45
TSTA3-209ENST00000529048 OSCARQ8IYS5 282 aa24.14■■□□□ 1.45
TSTA3-209ENST00000529048 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.14■■□□□ 1.45
TSTA3-209ENST00000529048 PBRM1Q86U86 1689 aa24.11■■□□□ 1.45
TSTA3-209ENST00000529048 FBLN2P98095 1184 aa24.11■■□□□ 1.45
TSTA3-209ENST00000529048 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.11■■□□□ 1.45
TSTA3-209ENST00000529048 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.09■■□□□ 1.45
TSTA3-209ENST00000529048 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.09■■□□□ 1.45
TSTA3-209ENST00000529048 GRIN2BQ13224 1484 aa24.07■■□□□ 1.44
TSTA3-209ENST00000529048 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
TSTA3-209ENST00000529048 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
TSTA3-209ENST00000529048 SYNJ2O15056 1496 aa23.93■■□□□ 1.42
TSTA3-209ENST00000529048 ADAMTS12P58397 1594 aa23.87■■□□□ 1.41
TSTA3-209ENST00000529048 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.84■■□□□ 1.41
TSTA3-209ENST00000529048 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.84■■□□□ 1.41
TSTA3-209ENST00000529048 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.84■■□□□ 1.41
TSTA3-209ENST00000529048 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.83■■□□□ 1.41
TSTA3-209ENST00000529048 TRIM41Q8WV44 630 aa23.82■■□□□ 1.4
TSTA3-209ENST00000529048 ARHGEF11O15085 1522 aa23.79■■□□□ 1.4
TSTA3-209ENST00000529048 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.79■■□□□ 1.4
TSTA3-209ENST00000529048 GRIN2AQ12879 1464 aa23.78■■□□□ 1.4
TSTA3-209ENST00000529048 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.77■■□□□ 1.4
TSTA3-209ENST00000529048 KIF27Q86VH2 1401 aa23.77■■□□□ 1.4
TSTA3-209ENST00000529048 CEP170Q5SW79 1584 aa23.72■■□□□ 1.39
TSTA3-209ENST00000529048 IGF1RP08069 1367 aa23.7■■□□□ 1.38
TSTA3-209ENST00000529048 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.68■■□□□ 1.38
TSTA3-209ENST00000529048 NUP160Q12769 1436 aa23.65■■□□□ 1.38
TSTA3-209ENST00000529048 CUL7Q14999 1698 aa23.64■■□□□ 1.37
TSTA3-209ENST00000529048 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.62■■□□□ 1.37
TSTA3-209ENST00000529048 ARAP1Q96P48 1450 aa23.61■■□□□ 1.37
TSTA3-209ENST00000529048 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.56■■□□□ 1.36
TSTA3-209ENST00000529048 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.56■■□□□ 1.36
TSTA3-209ENST00000529048 SHROOM2Q13796 1616 aa23.5■■□□□ 1.35
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