RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529064.5

TSTA3-210, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSTA3, Length 1,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-210ENST00000529064 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.53■■■□□ 2.32
TSTA3-210ENST00000529064 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.95■■□□□ 1.74
TSTA3-210ENST00000529064 ABCC9O60706 1549 aa24.78■■□□□ 1.56
TSTA3-210ENST00000529064 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
TSTA3-210ENST00000529064 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.42■■□□□ 1.5
TSTA3-210ENST00000529064 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.35■■□□□ 1.49
TSTA3-210ENST00000529064 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.24■■□□□ 1.47
TSTA3-210ENST00000529064 NACADO15069 1562 aa24.2■■□□□ 1.46
TSTA3-210ENST00000529064 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.06■■□□□ 1.44
TSTA3-210ENST00000529064 SCRIBQ14160 1630 aa23.78■■□□□ 1.4
TSTA3-210ENST00000529064 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.77■■□□□ 1.4
TSTA3-210ENST00000529064 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.74■■□□□ 1.39
TSTA3-210ENST00000529064 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.45■■□□□ 1.34
TSTA3-210ENST00000529064 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.29■■□□□ 1.322e-7■■■■□ 25
TSTA3-210ENST00000529064 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.99■■□□□ 1.27
TSTA3-210ENST00000529064 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.82■■□□□ 1.24
TSTA3-210ENST00000529064 SMARCA4P51532 1647 aa22.79■■□□□ 1.24
TSTA3-210ENST00000529064 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
TSTA3-210ENST00000529064 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
TSTA3-210ENST00000529064 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
TSTA3-210ENST00000529064 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
TSTA3-210ENST00000529064 WIZO95785 1651 aa22.65■■□□□ 1.22
TSTA3-210ENST00000529064 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.53■■□□□ 1.2
TSTA3-210ENST00000529064 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.47■■□□□ 1.19
TSTA3-210ENST00000529064 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.46■■□□□ 1.19
TSTA3-210ENST00000529064 SMARCA2P51531 1590 aa22.42■■□□□ 1.18
TSTA3-210ENST00000529064 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
TSTA3-210ENST00000529064 NCAPD3P42695 1498 aa22.33■■□□□ 1.17
TSTA3-210ENST00000529064 HMGXB3Q12766 1538 aa22.28■■□□□ 1.16
TSTA3-210ENST00000529064 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
TSTA3-210ENST00000529064 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.24■■□□□ 1.15
TSTA3-210ENST00000529064 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.12■■□□□ 1.13
TSTA3-210ENST00000529064 CFTRP13569 1480 aa21.73■■□□□ 1.07
TSTA3-210ENST00000529064 PRDM2Q13029 1718 aa21.72■■□□□ 1.07
TSTA3-210ENST00000529064 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.71■■□□□ 1.07
TSTA3-210ENST00000529064 NESP48681 1621 aa21.7■■□□□ 1.06
TSTA3-210ENST00000529064 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.62■■□□□ 1.05
TSTA3-210ENST00000529064 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.58■■□□□ 1.05
TSTA3-210ENST00000529064 ABCC8Q09428 1581 aa21.55■■□□□ 1.04
TSTA3-210ENST00000529064 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.48■■□□□ 1.03
TSTA3-210ENST00000529064 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.47■■□□□ 1.03
TSTA3-210ENST00000529064 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.41■■□□□ 1.02
TSTA3-210ENST00000529064 SYNJ1O43426 1573 aa21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-210ENST00000529064 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.38■■□□□ 1.01
TSTA3-210ENST00000529064 CUX1P39880 1505 aa21.36■■□□□ 1.01
TSTA3-210ENST00000529064 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.35■■□□□ 1.01
TSTA3-210ENST00000529064 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.34■■□□□ 1.01
TSTA3-210ENST00000529064 TOP2BQ02880 1626 aa21.32■■□□□ 1
TSTA3-210ENST00000529064 TRIM41Q8WV44 630 aa21.31■■□□□ 1
TSTA3-210ENST00000529064 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
TSTA3-210ENST00000529064 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.25■□□□□ 0.99
TSTA3-210ENST00000529064 TOPBP1Q92547 1522 aa21.23■□□□□ 0.99
TSTA3-210ENST00000529064 ERCC6Q03468 1493 aa21.21■□□□□ 0.99
TSTA3-210ENST00000529064 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.2■□□□□ 0.98
TSTA3-210ENST00000529064 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
TSTA3-210ENST00000529064 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.14■□□□□ 0.97
TSTA3-210ENST00000529064 WDR62O43379 1518 aa21.13■□□□□ 0.97
TSTA3-210ENST00000529064 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
TSTA3-210ENST00000529064 SOGA1O94964 1423 aa21.05■□□□□ 0.96
TSTA3-210ENST00000529064 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.05■□□□□ 0.96
TSTA3-210ENST00000529064 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.04■□□□□ 0.96
TSTA3-210ENST00000529064 WDR97A6NE52 1622 aa21.01■□□□□ 0.95
TSTA3-210ENST00000529064 CUX2O14529 1486 aa21.01■□□□□ 0.95
TSTA3-210ENST00000529064 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
TSTA3-210ENST00000529064 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.94■□□□□ 0.94
TSTA3-210ENST00000529064 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
TSTA3-210ENST00000529064 IFT140Q96RY7 1462 aa20.87■□□□□ 0.93
TSTA3-210ENST00000529064 EEA1Q15075 1411 aa20.86■□□□□ 0.93
TSTA3-210ENST00000529064 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.85■□□□□ 0.93
TSTA3-210ENST00000529064 KIF27Q86VH2 1401 aa20.85■□□□□ 0.93
TSTA3-210ENST00000529064 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.92
TSTA3-210ENST00000529064 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
TSTA3-210ENST00000529064 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.8■□□□□ 0.92
TSTA3-210ENST00000529064 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.77■□□□□ 0.927e-7■■■■■ 34.5
TSTA3-210ENST00000529064 PBRM1Q86U86 1689 aa20.77■□□□□ 0.91
TSTA3-210ENST00000529064 IGF1RP08069 1367 aa20.76■□□□□ 0.91
TSTA3-210ENST00000529064 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.76■□□□□ 0.91
TSTA3-210ENST00000529064 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa20.75■□□□□ 0.91
TSTA3-210ENST00000529064 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
TSTA3-210ENST00000529064 KIF21BO75037 1637 aa20.69■□□□□ 0.9
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TSTA3-210ENST00000529064 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.68■□□□□ 0.9
TSTA3-210ENST00000529064 GRIN2BQ13224 1484 aa20.65■□□□□ 0.9
TSTA3-210ENST00000529064 CUL7Q14999 1698 aa20.64■□□□□ 0.89
TSTA3-210ENST00000529064 EHMT2Q96KQ7 1210 aa20.64■□□□□ 0.89
TSTA3-210ENST00000529064 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.64■□□□□ 0.89
TSTA3-210ENST00000529064 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.62■□□□□ 0.89
TSTA3-210ENST00000529064 ADAMTS12P58397 1594 aa20.59■□□□□ 0.89
TSTA3-210ENST00000529064 GOLGA3Q08378 1498 aa20.58■□□□□ 0.88
TSTA3-210ENST00000529064 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.56■□□□□ 0.88
TSTA3-210ENST00000529064 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.52■□□□□ 0.87
TSTA3-210ENST00000529064 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
TSTA3-210ENST00000529064 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa20.47■□□□□ 0.87
TSTA3-210ENST00000529064 TNIKQ9UKE5 1360 aa20.46■□□□□ 0.87
TSTA3-210ENST00000529064 UBTFP17480 764 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
TSTA3-210ENST00000529064 SYNJ2O15056 1496 aa20.43■□□□□ 0.86
TSTA3-210ENST00000529064 CHD1O14646 1710 aa20.43■□□□□ 0.86
TSTA3-210ENST00000529064 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.41■□□□□ 0.86
TSTA3-210ENST00000529064 GRIN2AQ12879 1464 aa20.4■□□□□ 0.86
TSTA3-210ENST00000529064 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
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