Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAB18Q9NP72 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAB18Q9NP72 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAB18Q9NP72 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAB18Q9NP72 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB18Q9NP72 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB18Q9NP72 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB18Q9NP72 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB18Q9NP72 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB18Q9NP72 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB18Q9NP72 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB18Q9NP72 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB18Q9NP72 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB18Q9NP72 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB18Q9NP72 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB18Q9NP72 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB18Q9NP72 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB18Q9NP72 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB18Q9NP72 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAB18Q9NP72 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAB18Q9NP72 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAB18Q9NP72 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RAB18Q9NP72 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RAB18Q9NP72 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RAB18Q9NP72 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB18Q9NP72 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB18Q9NP72 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB18Q9NP72 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB18Q9NP72 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB18Q9NP72 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB18Q9NP72 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB18Q9NP72 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB18Q9NP72 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB18Q9NP72 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB18Q9NP72 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB18Q9NP72 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB18Q9NP72 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB18Q9NP72 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB18Q9NP72 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB18Q9NP72 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB18Q9NP72 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB18Q9NP72 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB18Q9NP72 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB18Q9NP72 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB18Q9NP72 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB18Q9NP72 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB18Q9NP72 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB18Q9NP72 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB18Q9NP72 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB18Q9NP72 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB18Q9NP72 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB18Q9NP72 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB18Q9NP72 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB18Q9NP72 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB18Q9NP72 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB18Q9NP72 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB18Q9NP72 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB18Q9NP72 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB18Q9NP72 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB18Q9NP72 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB18Q9NP72 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB18Q9NP72 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB18Q9NP72 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB18Q9NP72 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAB18Q9NP72 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB18Q9NP72 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB18Q9NP72 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB18Q9NP72 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB18Q9NP72 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB18Q9NP72 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB18Q9NP72 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB18Q9NP72 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB18Q9NP72 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB18Q9NP72 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB18Q9NP72 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB18Q9NP72 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB18Q9NP72 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB18Q9NP72 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB18Q9NP72 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB18Q9NP72 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB18Q9NP72 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB18Q9NP72 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB18Q9NP72 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB18Q9NP72 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB18Q9NP72 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB18Q9NP72 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB18Q9NP72 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB18Q9NP72 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB18Q9NP72 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB18Q9NP72 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB18Q9NP72 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB18Q9NP72 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB18Q9NP72 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB18Q9NP72 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB18Q9NP72 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB18Q9NP72 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB18Q9NP72 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB18Q9NP72 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB18Q9NP72 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB18Q9NP72 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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