Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLXNA4Q9HCM2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLXNA4Q9HCM2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLXNA4Q9HCM2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLXNA4Q9HCM2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLXNA4Q9HCM2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLXNA4Q9HCM2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLXNA4Q9HCM2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLXNA4Q9HCM2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PLXNA4Q9HCM2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLXNA4Q9HCM2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLXNA4Q9HCM2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PLXNA4Q9HCM2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLXNA4Q9HCM2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLXNA4Q9HCM2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLXNA4Q9HCM2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLXNA4Q9HCM2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLXNA4Q9HCM2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PLXNA4Q9HCM2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PLXNA4Q9HCM2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PLXNA4Q9HCM2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PLXNA4Q9HCM2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PLXNA4Q9HCM2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PLXNA4Q9HCM2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PLXNA4Q9HCM2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PLXNA4Q9HCM2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PLXNA4Q9HCM2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PLXNA4Q9HCM2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PLXNA4Q9HCM2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLXNA4Q9HCM2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLXNA4Q9HCM2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLXNA4Q9HCM2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLXNA4Q9HCM2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PLXNA4Q9HCM2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PLXNA4Q9HCM2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PLXNA4Q9HCM2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PLXNA4Q9HCM2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PLXNA4Q9HCM2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PLXNA4Q9HCM2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PLXNA4Q9HCM2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PLXNA4Q9HCM2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PLXNA4Q9HCM2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PLXNA4Q9HCM2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PLXNA4Q9HCM2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PLXNA4Q9HCM2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLXNA4Q9HCM2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PLXNA4Q9HCM2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLXNA4Q9HCM2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLXNA4Q9HCM2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLXNA4Q9HCM2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLXNA4Q9HCM2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLXNA4Q9HCM2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLXNA4Q9HCM2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLXNA4Q9HCM2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLXNA4Q9HCM2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLXNA4Q9HCM2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLXNA4Q9HCM2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLXNA4Q9HCM2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLXNA4Q9HCM2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLXNA4Q9HCM2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLXNA4Q9HCM2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLXNA4Q9HCM2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLXNA4Q9HCM2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLXNA4Q9HCM2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLXNA4Q9HCM2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLXNA4Q9HCM2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLXNA4Q9HCM2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLXNA4Q9HCM2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLXNA4Q9HCM2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLXNA4Q9HCM2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLXNA4Q9HCM2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLXNA4Q9HCM2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLXNA4Q9HCM2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLXNA4Q9HCM2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLXNA4Q9HCM2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PLXNA4Q9HCM2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLXNA4Q9HCM2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLXNA4Q9HCM2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLXNA4Q9HCM2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLXNA4Q9HCM2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLXNA4Q9HCM2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLXNA4Q9HCM2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLXNA4Q9HCM2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLXNA4Q9HCM2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PLXNA4Q9HCM2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLXNA4Q9HCM2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLXNA4Q9HCM2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLXNA4Q9HCM2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLXNA4Q9HCM2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLXNA4Q9HCM2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLXNA4Q9HCM2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PLXNA4Q9HCM2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PLXNA4Q9HCM2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PLXNA4Q9HCM2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PLXNA4Q9HCM2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PLXNA4Q9HCM2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLXNA4Q9HCM2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLXNA4Q9HCM2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLXNA4Q9HCM2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLXNA4Q9HCM2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms