Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J1

B3GNT4, N-acetyllactosaminide beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3GNT4Q9C0J1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
B3GNT4Q9C0J1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
B3GNT4Q9C0J1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
B3GNT4Q9C0J1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
B3GNT4Q9C0J1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
B3GNT4Q9C0J1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
B3GNT4Q9C0J1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
B3GNT4Q9C0J1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
B3GNT4Q9C0J1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
B3GNT4Q9C0J1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
B3GNT4Q9C0J1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
B3GNT4Q9C0J1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
B3GNT4Q9C0J1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
B3GNT4Q9C0J1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
B3GNT4Q9C0J1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
B3GNT4Q9C0J1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
B3GNT4Q9C0J1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
B3GNT4Q9C0J1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
B3GNT4Q9C0J1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
B3GNT4Q9C0J1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
B3GNT4Q9C0J1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
B3GNT4Q9C0J1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
B3GNT4Q9C0J1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
B3GNT4Q9C0J1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
B3GNT4Q9C0J1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
B3GNT4Q9C0J1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
B3GNT4Q9C0J1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
B3GNT4Q9C0J1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
B3GNT4Q9C0J1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
B3GNT4Q9C0J1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
B3GNT4Q9C0J1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
B3GNT4Q9C0J1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
B3GNT4Q9C0J1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
B3GNT4Q9C0J1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
B3GNT4Q9C0J1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
B3GNT4Q9C0J1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
B3GNT4Q9C0J1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
B3GNT4Q9C0J1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
B3GNT4Q9C0J1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
B3GNT4Q9C0J1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
B3GNT4Q9C0J1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
B3GNT4Q9C0J1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
B3GNT4Q9C0J1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
B3GNT4Q9C0J1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
B3GNT4Q9C0J1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
B3GNT4Q9C0J1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
B3GNT4Q9C0J1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
B3GNT4Q9C0J1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
B3GNT4Q9C0J1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
B3GNT4Q9C0J1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
B3GNT4Q9C0J1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
B3GNT4Q9C0J1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
B3GNT4Q9C0J1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
B3GNT4Q9C0J1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
B3GNT4Q9C0J1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
B3GNT4Q9C0J1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
B3GNT4Q9C0J1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
B3GNT4Q9C0J1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
B3GNT4Q9C0J1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
B3GNT4Q9C0J1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
B3GNT4Q9C0J1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
B3GNT4Q9C0J1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
B3GNT4Q9C0J1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
B3GNT4Q9C0J1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
B3GNT4Q9C0J1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
B3GNT4Q9C0J1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
B3GNT4Q9C0J1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
B3GNT4Q9C0J1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
B3GNT4Q9C0J1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
B3GNT4Q9C0J1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
B3GNT4Q9C0J1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
B3GNT4Q9C0J1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
B3GNT4Q9C0J1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
B3GNT4Q9C0J1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
B3GNT4Q9C0J1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
B3GNT4Q9C0J1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
B3GNT4Q9C0J1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
B3GNT4Q9C0J1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
B3GNT4Q9C0J1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
B3GNT4Q9C0J1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
B3GNT4Q9C0J1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
B3GNT4Q9C0J1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
B3GNT4Q9C0J1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
B3GNT4Q9C0J1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
B3GNT4Q9C0J1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
B3GNT4Q9C0J1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
B3GNT4Q9C0J1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
B3GNT4Q9C0J1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
B3GNT4Q9C0J1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
B3GNT4Q9C0J1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
B3GNT4Q9C0J1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
B3GNT4Q9C0J1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
B3GNT4Q9C0J1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
B3GNT4Q9C0J1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
B3GNT4Q9C0J1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
B3GNT4Q9C0J1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
B3GNT4Q9C0J1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
B3GNT4Q9C0J1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
B3GNT4Q9C0J1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
B3GNT4Q9C0J1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms