Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms