Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRTAP1-5Q9BYS1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRTAP1-5Q9BYS1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRTAP1-5Q9BYS1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRTAP1-5Q9BYS1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRTAP1-5Q9BYS1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRTAP1-5Q9BYS1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KRTAP1-5Q9BYS1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRTAP1-5Q9BYS1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRTAP1-5Q9BYS1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRTAP1-5Q9BYS1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRTAP1-5Q9BYS1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRTAP1-5Q9BYS1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRTAP1-5Q9BYS1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRTAP1-5Q9BYS1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRTAP1-5Q9BYS1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRTAP1-5Q9BYS1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRTAP1-5Q9BYS1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRTAP1-5Q9BYS1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRTAP1-5Q9BYS1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRTAP1-5Q9BYS1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRTAP1-5Q9BYS1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRTAP1-5Q9BYS1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRTAP1-5Q9BYS1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRTAP1-5Q9BYS1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRTAP1-5Q9BYS1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRTAP1-5Q9BYS1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRTAP1-5Q9BYS1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRTAP1-5Q9BYS1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRTAP1-5Q9BYS1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KRTAP1-5Q9BYS1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KRTAP1-5Q9BYS1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KRTAP1-5Q9BYS1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRTAP1-5Q9BYS1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRTAP1-5Q9BYS1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KRTAP1-5Q9BYS1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KRTAP1-5Q9BYS1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
KRTAP1-5Q9BYS1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KRTAP1-5Q9BYS1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KRTAP1-5Q9BYS1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRTAP1-5Q9BYS1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRTAP1-5Q9BYS1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KRTAP1-5Q9BYS1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KRTAP1-5Q9BYS1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRTAP1-5Q9BYS1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRTAP1-5Q9BYS1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRTAP1-5Q9BYS1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
KRTAP1-5Q9BYS1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KRTAP1-5Q9BYS1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRTAP1-5Q9BYS1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRTAP1-5Q9BYS1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KRTAP1-5Q9BYS1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KRTAP1-5Q9BYS1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KRTAP1-5Q9BYS1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KRTAP1-5Q9BYS1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KRTAP1-5Q9BYS1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KRTAP1-5Q9BYS1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KRTAP1-5Q9BYS1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 360.7 ms