Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTDSS2Q9BVG9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTDSS2Q9BVG9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTDSS2Q9BVG9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTDSS2Q9BVG9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTDSS2Q9BVG9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTDSS2Q9BVG9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTDSS2Q9BVG9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTDSS2Q9BVG9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTDSS2Q9BVG9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTDSS2Q9BVG9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTDSS2Q9BVG9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTDSS2Q9BVG9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTDSS2Q9BVG9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTDSS2Q9BVG9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTDSS2Q9BVG9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTDSS2Q9BVG9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTDSS2Q9BVG9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTDSS2Q9BVG9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTDSS2Q9BVG9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTDSS2Q9BVG9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTDSS2Q9BVG9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTDSS2Q9BVG9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTDSS2Q9BVG9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTDSS2Q9BVG9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTDSS2Q9BVG9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTDSS2Q9BVG9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTDSS2Q9BVG9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTDSS2Q9BVG9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTDSS2Q9BVG9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTDSS2Q9BVG9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTDSS2Q9BVG9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTDSS2Q9BVG9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTDSS2Q9BVG9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTDSS2Q9BVG9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTDSS2Q9BVG9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTDSS2Q9BVG9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTDSS2Q9BVG9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTDSS2Q9BVG9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTDSS2Q9BVG9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTDSS2Q9BVG9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTDSS2Q9BVG9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTDSS2Q9BVG9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTDSS2Q9BVG9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTDSS2Q9BVG9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTDSS2Q9BVG9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTDSS2Q9BVG9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTDSS2Q9BVG9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTDSS2Q9BVG9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTDSS2Q9BVG9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTDSS2Q9BVG9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTDSS2Q9BVG9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTDSS2Q9BVG9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTDSS2Q9BVG9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTDSS2Q9BVG9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTDSS2Q9BVG9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTDSS2Q9BVG9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTDSS2Q9BVG9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTDSS2Q9BVG9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTDSS2Q9BVG9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTDSS2Q9BVG9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTDSS2Q9BVG9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTDSS2Q9BVG9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTDSS2Q9BVG9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTDSS2Q9BVG9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTDSS2Q9BVG9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTDSS2Q9BVG9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTDSS2Q9BVG9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTDSS2Q9BVG9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTDSS2Q9BVG9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTDSS2Q9BVG9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTDSS2Q9BVG9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTDSS2Q9BVG9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTDSS2Q9BVG9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTDSS2Q9BVG9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTDSS2Q9BVG9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTDSS2Q9BVG9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTDSS2Q9BVG9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTDSS2Q9BVG9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTDSS2Q9BVG9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTDSS2Q9BVG9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTDSS2Q9BVG9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTDSS2Q9BVG9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTDSS2Q9BVG9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTDSS2Q9BVG9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTDSS2Q9BVG9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTDSS2Q9BVG9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTDSS2Q9BVG9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTDSS2Q9BVG9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTDSS2Q9BVG9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTDSS2Q9BVG9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTDSS2Q9BVG9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTDSS2Q9BVG9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTDSS2Q9BVG9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTDSS2Q9BVG9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTDSS2Q9BVG9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTDSS2Q9BVG9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTDSS2Q9BVG9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTDSS2Q9BVG9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTDSS2Q9BVG9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.7 ms