Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GORASP1Q9BQQ3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GORASP1Q9BQQ3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GORASP1Q9BQQ3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GORASP1Q9BQQ3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GORASP1Q9BQQ3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GORASP1Q9BQQ3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GORASP1Q9BQQ3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GORASP1Q9BQQ3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GORASP1Q9BQQ3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GORASP1Q9BQQ3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GORASP1Q9BQQ3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GORASP1Q9BQQ3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GORASP1Q9BQQ3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GORASP1Q9BQQ3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GORASP1Q9BQQ3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GORASP1Q9BQQ3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GORASP1Q9BQQ3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GORASP1Q9BQQ3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
GORASP1Q9BQQ3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GORASP1Q9BQQ3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GORASP1Q9BQQ3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GORASP1Q9BQQ3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GORASP1Q9BQQ3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GORASP1Q9BQQ3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GORASP1Q9BQQ3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GORASP1Q9BQQ3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GORASP1Q9BQQ3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GORASP1Q9BQQ3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GORASP1Q9BQQ3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GORASP1Q9BQQ3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GORASP1Q9BQQ3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GORASP1Q9BQQ3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GORASP1Q9BQQ3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GORASP1Q9BQQ3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GORASP1Q9BQQ3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GORASP1Q9BQQ3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GORASP1Q9BQQ3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GORASP1Q9BQQ3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GORASP1Q9BQQ3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GORASP1Q9BQQ3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GORASP1Q9BQQ3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GORASP1Q9BQQ3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GORASP1Q9BQQ3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GORASP1Q9BQQ3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GORASP1Q9BQQ3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GORASP1Q9BQQ3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GORASP1Q9BQQ3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GORASP1Q9BQQ3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GORASP1Q9BQQ3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GORASP1Q9BQQ3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GORASP1Q9BQQ3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GORASP1Q9BQQ3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GORASP1Q9BQQ3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GORASP1Q9BQQ3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GORASP1Q9BQQ3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GORASP1Q9BQQ3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GORASP1Q9BQQ3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GORASP1Q9BQQ3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GORASP1Q9BQQ3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GORASP1Q9BQQ3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GORASP1Q9BQQ3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GORASP1Q9BQQ3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GORASP1Q9BQQ3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GORASP1Q9BQQ3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GORASP1Q9BQQ3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GORASP1Q9BQQ3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GORASP1Q9BQQ3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GORASP1Q9BQQ3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GORASP1Q9BQQ3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GORASP1Q9BQQ3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GORASP1Q9BQQ3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GORASP1Q9BQQ3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GORASP1Q9BQQ3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GORASP1Q9BQQ3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GORASP1Q9BQQ3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GORASP1Q9BQQ3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GORASP1Q9BQQ3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GORASP1Q9BQQ3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GORASP1Q9BQQ3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GORASP1Q9BQQ3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GORASP1Q9BQQ3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GORASP1Q9BQQ3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GORASP1Q9BQQ3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GORASP1Q9BQQ3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GORASP1Q9BQQ3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GORASP1Q9BQQ3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GORASP1Q9BQQ3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GORASP1Q9BQQ3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GORASP1Q9BQQ3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GORASP1Q9BQQ3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GORASP1Q9BQQ3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GORASP1Q9BQQ3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GORASP1Q9BQQ3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GORASP1Q9BQQ3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GORASP1Q9BQQ3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GORASP1Q9BQQ3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GORASP1Q9BQQ3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GORASP1Q9BQQ3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GORASP1Q9BQQ3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms