Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LGMNQ99538 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LGMNQ99538 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LGMNQ99538 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LGMNQ99538 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LGMNQ99538 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LGMNQ99538 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LGMNQ99538 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LGMNQ99538 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LGMNQ99538 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LGMNQ99538 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LGMNQ99538 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LGMNQ99538 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LGMNQ99538 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LGMNQ99538 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LGMNQ99538 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LGMNQ99538 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LGMNQ99538 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LGMNQ99538 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LGMNQ99538 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LGMNQ99538 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LGMNQ99538 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LGMNQ99538 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LGMNQ99538 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LGMNQ99538 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LGMNQ99538 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LGMNQ99538 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LGMNQ99538 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LGMNQ99538 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LGMNQ99538 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LGMNQ99538 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LGMNQ99538 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LGMNQ99538 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LGMNQ99538 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LGMNQ99538 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LGMNQ99538 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LGMNQ99538 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LGMNQ99538 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LGMNQ99538 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LGMNQ99538 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LGMNQ99538 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LGMNQ99538 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LGMNQ99538 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LGMNQ99538 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LGMNQ99538 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LGMNQ99538 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LGMNQ99538 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LGMNQ99538 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LGMNQ99538 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LGMNQ99538 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LGMNQ99538 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LGMNQ99538 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LGMNQ99538 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LGMNQ99538 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LGMNQ99538 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LGMNQ99538 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LGMNQ99538 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LGMNQ99538 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LGMNQ99538 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LGMNQ99538 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LGMNQ99538 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LGMNQ99538 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LGMNQ99538 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LGMNQ99538 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LGMNQ99538 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LGMNQ99538 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LGMNQ99538 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LGMNQ99538 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LGMNQ99538 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LGMNQ99538 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LGMNQ99538 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LGMNQ99538 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LGMNQ99538 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LGMNQ99538 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LGMNQ99538 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LGMNQ99538 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LGMNQ99538 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LGMNQ99538 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LGMNQ99538 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LGMNQ99538 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LGMNQ99538 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LGMNQ99538 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LGMNQ99538 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LGMNQ99538 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LGMNQ99538 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LGMNQ99538 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LGMNQ99538 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LGMNQ99538 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LGMNQ99538 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LGMNQ99538 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LGMNQ99538 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LGMNQ99538 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LGMNQ99538 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LGMNQ99538 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LGMNQ99538 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LGMNQ99538 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LGMNQ99538 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LGMNQ99538 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LGMNQ99538 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LGMNQ99538 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms