Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RAD50Q92878 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RAD50Q92878 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RAD50Q92878 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RAD50Q92878 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RAD50Q92878 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RAD50Q92878 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RAD50Q92878 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RAD50Q92878 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RAD50Q92878 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RAD50Q92878 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RAD50Q92878 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
RAD50Q92878 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
RAD50Q92878 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RAD50Q92878 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RAD50Q92878 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RAD50Q92878 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RAD50Q92878 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RAD50Q92878 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RAD50Q92878 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RAD50Q92878 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RAD50Q92878 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RAD50Q92878 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RAD50Q92878 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RAD50Q92878 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RAD50Q92878 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RAD50Q92878 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RAD50Q92878 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RAD50Q92878 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RAD50Q92878 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RAD50Q92878 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RAD50Q92878 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RAD50Q92878 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RAD50Q92878 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RAD50Q92878 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAD50Q92878 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAD50Q92878 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAD50Q92878 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAD50Q92878 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RAD50Q92878 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RAD50Q92878 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RAD50Q92878 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RAD50Q92878 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RAD50Q92878 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RAD50Q92878 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RAD50Q92878 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RAD50Q92878 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RAD50Q92878 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RAD50Q92878 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RAD50Q92878 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RAD50Q92878 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RAD50Q92878 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RAD50Q92878 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RAD50Q92878 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
RAD50Q92878 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RAD50Q92878 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
RAD50Q92878 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RAD50Q92878 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RAD50Q92878 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
RAD50Q92878 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RAD50Q92878 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RAD50Q92878 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RAD50Q92878 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RAD50Q92878 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RAD50Q92878 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RAD50Q92878 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
RAD50Q92878 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RAD50Q92878 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RAD50Q92878 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RAD50Q92878 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RAD50Q92878 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RAD50Q92878 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
RAD50Q92878 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RAD50Q92878 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RAD50Q92878 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RAD50Q92878 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RAD50Q92878 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RAD50Q92878 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RAD50Q92878 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RAD50Q92878 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RAD50Q92878 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RAD50Q92878 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RAD50Q92878 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RAD50Q92878 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RAD50Q92878 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RAD50Q92878 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RAD50Q92878 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RAD50Q92878 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RAD50Q92878 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RAD50Q92878 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RAD50Q92878 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
RAD50Q92878 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RAD50Q92878 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RAD50Q92878 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RAD50Q92878 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RAD50Q92878 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RAD50Q92878 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
RAD50Q92878 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RAD50Q92878 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RAD50Q92878 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms