Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTF1AQ7RTS3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTF1AQ7RTS3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTF1AQ7RTS3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTF1AQ7RTS3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTF1AQ7RTS3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTF1AQ7RTS3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTF1AQ7RTS3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTF1AQ7RTS3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTF1AQ7RTS3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTF1AQ7RTS3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTF1AQ7RTS3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTF1AQ7RTS3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTF1AQ7RTS3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTF1AQ7RTS3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTF1AQ7RTS3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTF1AQ7RTS3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
PTF1AQ7RTS3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTF1AQ7RTS3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTF1AQ7RTS3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTF1AQ7RTS3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
PTF1AQ7RTS3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
PTF1AQ7RTS3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTF1AQ7RTS3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTF1AQ7RTS3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTF1AQ7RTS3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
PTF1AQ7RTS3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTF1AQ7RTS3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PTF1AQ7RTS3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PTF1AQ7RTS3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PTF1AQ7RTS3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PTF1AQ7RTS3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTF1AQ7RTS3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTF1AQ7RTS3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTF1AQ7RTS3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTF1AQ7RTS3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTF1AQ7RTS3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
PTF1AQ7RTS3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PTF1AQ7RTS3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PTF1AQ7RTS3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PTF1AQ7RTS3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTF1AQ7RTS3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTF1AQ7RTS3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
PTF1AQ7RTS3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTF1AQ7RTS3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTF1AQ7RTS3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTF1AQ7RTS3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
PTF1AQ7RTS3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTF1AQ7RTS3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
PTF1AQ7RTS3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTF1AQ7RTS3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTF1AQ7RTS3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTF1AQ7RTS3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTF1AQ7RTS3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTF1AQ7RTS3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTF1AQ7RTS3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTF1AQ7RTS3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
PTF1AQ7RTS3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTF1AQ7RTS3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PTF1AQ7RTS3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PTF1AQ7RTS3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PTF1AQ7RTS3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTF1AQ7RTS3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTF1AQ7RTS3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
PTF1AQ7RTS3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTF1AQ7RTS3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTF1AQ7RTS3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTF1AQ7RTS3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTF1AQ7RTS3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTF1AQ7RTS3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTF1AQ7RTS3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
PTF1AQ7RTS3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTF1AQ7RTS3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTF1AQ7RTS3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTF1AQ7RTS3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTF1AQ7RTS3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTF1AQ7RTS3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTF1AQ7RTS3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTF1AQ7RTS3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTF1AQ7RTS3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTF1AQ7RTS3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTF1AQ7RTS3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTF1AQ7RTS3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTF1AQ7RTS3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTF1AQ7RTS3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTF1AQ7RTS3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
PTF1AQ7RTS3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTF1AQ7RTS3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTF1AQ7RTS3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTF1AQ7RTS3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTF1AQ7RTS3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
PTF1AQ7RTS3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTF1AQ7RTS3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTF1AQ7RTS3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTF1AQ7RTS3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTF1AQ7RTS3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTF1AQ7RTS3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTF1AQ7RTS3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTF1AQ7RTS3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTF1AQ7RTS3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms