Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX40

TMEM107, Transmembrane protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM107Q6UX40 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM107Q6UX40 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM107Q6UX40 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM107Q6UX40 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM107Q6UX40 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM107Q6UX40 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM107Q6UX40 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM107Q6UX40 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM107Q6UX40 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM107Q6UX40 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM107Q6UX40 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM107Q6UX40 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM107Q6UX40 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM107Q6UX40 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM107Q6UX40 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM107Q6UX40 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM107Q6UX40 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM107Q6UX40 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM107Q6UX40 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM107Q6UX40 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM107Q6UX40 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM107Q6UX40 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM107Q6UX40 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM107Q6UX40 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM107Q6UX40 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM107Q6UX40 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM107Q6UX40 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM107Q6UX40 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM107Q6UX40 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM107Q6UX40 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM107Q6UX40 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM107Q6UX40 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM107Q6UX40 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM107Q6UX40 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TMEM107Q6UX40 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM107Q6UX40 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM107Q6UX40 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM107Q6UX40 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM107Q6UX40 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM107Q6UX40 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM107Q6UX40 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM107Q6UX40 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM107Q6UX40 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM107Q6UX40 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM107Q6UX40 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM107Q6UX40 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM107Q6UX40 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM107Q6UX40 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM107Q6UX40 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM107Q6UX40 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM107Q6UX40 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM107Q6UX40 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM107Q6UX40 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM107Q6UX40 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM107Q6UX40 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM107Q6UX40 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM107Q6UX40 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM107Q6UX40 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM107Q6UX40 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM107Q6UX40 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM107Q6UX40 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM107Q6UX40 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM107Q6UX40 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM107Q6UX40 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM107Q6UX40 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM107Q6UX40 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM107Q6UX40 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM107Q6UX40 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM107Q6UX40 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM107Q6UX40 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM107Q6UX40 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM107Q6UX40 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM107Q6UX40 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM107Q6UX40 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM107Q6UX40 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM107Q6UX40 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM107Q6UX40 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM107Q6UX40 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM107Q6UX40 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM107Q6UX40 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM107Q6UX40 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM107Q6UX40 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM107Q6UX40 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM107Q6UX40 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM107Q6UX40 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM107Q6UX40 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM107Q6UX40 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM107Q6UX40 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM107Q6UX40 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM107Q6UX40 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM107Q6UX40 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM107Q6UX40 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM107Q6UX40 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM107Q6UX40 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM107Q6UX40 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM107Q6UX40 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM107Q6UX40 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM107Q6UX40 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM107Q6UX40 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM107Q6UX40 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms