Protein–RNA interactions for Protein: Q63HM1

AFMID, Kynurenine formamidase, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMIDQ63HM1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AFMIDQ63HM1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AFMIDQ63HM1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AFMIDQ63HM1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AFMIDQ63HM1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AFMIDQ63HM1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AFMIDQ63HM1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AFMIDQ63HM1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AFMIDQ63HM1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AFMIDQ63HM1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AFMIDQ63HM1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AFMIDQ63HM1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AFMIDQ63HM1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AFMIDQ63HM1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AFMIDQ63HM1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AFMIDQ63HM1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AFMIDQ63HM1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AFMIDQ63HM1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
AFMIDQ63HM1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AFMIDQ63HM1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AFMIDQ63HM1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AFMIDQ63HM1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AFMIDQ63HM1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AFMIDQ63HM1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AFMIDQ63HM1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
AFMIDQ63HM1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AFMIDQ63HM1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
AFMIDQ63HM1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AFMIDQ63HM1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AFMIDQ63HM1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AFMIDQ63HM1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AFMIDQ63HM1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AFMIDQ63HM1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
AFMIDQ63HM1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AFMIDQ63HM1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AFMIDQ63HM1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AFMIDQ63HM1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AFMIDQ63HM1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AFMIDQ63HM1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AFMIDQ63HM1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AFMIDQ63HM1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AFMIDQ63HM1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AFMIDQ63HM1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AFMIDQ63HM1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AFMIDQ63HM1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AFMIDQ63HM1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AFMIDQ63HM1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AFMIDQ63HM1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AFMIDQ63HM1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AFMIDQ63HM1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AFMIDQ63HM1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AFMIDQ63HM1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AFMIDQ63HM1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AFMIDQ63HM1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AFMIDQ63HM1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AFMIDQ63HM1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AFMIDQ63HM1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AFMIDQ63HM1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AFMIDQ63HM1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AFMIDQ63HM1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
AFMIDQ63HM1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
AFMIDQ63HM1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AFMIDQ63HM1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AFMIDQ63HM1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AFMIDQ63HM1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AFMIDQ63HM1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
AFMIDQ63HM1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AFMIDQ63HM1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AFMIDQ63HM1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AFMIDQ63HM1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AFMIDQ63HM1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AFMIDQ63HM1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AFMIDQ63HM1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AFMIDQ63HM1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AFMIDQ63HM1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AFMIDQ63HM1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AFMIDQ63HM1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AFMIDQ63HM1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AFMIDQ63HM1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AFMIDQ63HM1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AFMIDQ63HM1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AFMIDQ63HM1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AFMIDQ63HM1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AFMIDQ63HM1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AFMIDQ63HM1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AFMIDQ63HM1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AFMIDQ63HM1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AFMIDQ63HM1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AFMIDQ63HM1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AFMIDQ63HM1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AFMIDQ63HM1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AFMIDQ63HM1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AFMIDQ63HM1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AFMIDQ63HM1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AFMIDQ63HM1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AFMIDQ63HM1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AFMIDQ63HM1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AFMIDQ63HM1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AFMIDQ63HM1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AFMIDQ63HM1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms