Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
SUSD4Q5VX71 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SUSD4Q5VX71 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SUSD4Q5VX71 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SUSD4Q5VX71 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SUSD4Q5VX71 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SUSD4Q5VX71 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
SUSD4Q5VX71 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SUSD4Q5VX71 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
SUSD4Q5VX71 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SUSD4Q5VX71 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SUSD4Q5VX71 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC31■■■□□ 2.55
SUSD4Q5VX71 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC31■■■□□ 2.55
SUSD4Q5VX71 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SUSD4Q5VX71 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SUSD4Q5VX71 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SUSD4Q5VX71 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SUSD4Q5VX71 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SUSD4Q5VX71 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SUSD4Q5VX71 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SUSD4Q5VX71 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SUSD4Q5VX71 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
SUSD4Q5VX71 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SUSD4Q5VX71 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SUSD4Q5VX71 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SUSD4Q5VX71 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SUSD4Q5VX71 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SUSD4Q5VX71 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SUSD4Q5VX71 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SUSD4Q5VX71 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SUSD4Q5VX71 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SUSD4Q5VX71 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SUSD4Q5VX71 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SUSD4Q5VX71 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SUSD4Q5VX71 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.54
SUSD4Q5VX71 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SUSD4Q5VX71 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SUSD4Q5VX71 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SUSD4Q5VX71 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SUSD4Q5VX71 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SUSD4Q5VX71 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SUSD4Q5VX71 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SUSD4Q5VX71 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SUSD4Q5VX71 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SUSD4Q5VX71 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SUSD4Q5VX71 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SUSD4Q5VX71 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SUSD4Q5VX71 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SUSD4Q5VX71 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SUSD4Q5VX71 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SUSD4Q5VX71 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SUSD4Q5VX71 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SUSD4Q5VX71 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SUSD4Q5VX71 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SUSD4Q5VX71 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SUSD4Q5VX71 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SUSD4Q5VX71 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SUSD4Q5VX71 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SUSD4Q5VX71 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SUSD4Q5VX71 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SUSD4Q5VX71 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SUSD4Q5VX71 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SUSD4Q5VX71 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SUSD4Q5VX71 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SUSD4Q5VX71 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SUSD4Q5VX71 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SUSD4Q5VX71 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SUSD4Q5VX71 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SUSD4Q5VX71 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SUSD4Q5VX71 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SUSD4Q5VX71 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SUSD4Q5VX71 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SUSD4Q5VX71 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SUSD4Q5VX71 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SUSD4Q5VX71 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SUSD4Q5VX71 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
SUSD4Q5VX71 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
SUSD4Q5VX71 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SUSD4Q5VX71 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
SUSD4Q5VX71 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SUSD4Q5VX71 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SUSD4Q5VX71 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SUSD4Q5VX71 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SUSD4Q5VX71 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SUSD4Q5VX71 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SUSD4Q5VX71 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SUSD4Q5VX71 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SUSD4Q5VX71 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SUSD4Q5VX71 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SUSD4Q5VX71 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SUSD4Q5VX71 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SUSD4Q5VX71 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SUSD4Q5VX71 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
SUSD4Q5VX71 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
SUSD4Q5VX71 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SUSD4Q5VX71 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SUSD4Q5VX71 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SUSD4Q5VX71 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SUSD4Q5VX71 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SUSD4Q5VX71 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms