Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PKDCCQ504Y2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PKDCCQ504Y2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PKDCCQ504Y2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PKDCCQ504Y2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PKDCCQ504Y2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKDCCQ504Y2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKDCCQ504Y2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKDCCQ504Y2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKDCCQ504Y2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKDCCQ504Y2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKDCCQ504Y2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKDCCQ504Y2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKDCCQ504Y2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKDCCQ504Y2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKDCCQ504Y2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKDCCQ504Y2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKDCCQ504Y2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKDCCQ504Y2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKDCCQ504Y2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PKDCCQ504Y2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PKDCCQ504Y2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PKDCCQ504Y2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PKDCCQ504Y2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKDCCQ504Y2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKDCCQ504Y2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKDCCQ504Y2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKDCCQ504Y2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKDCCQ504Y2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKDCCQ504Y2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKDCCQ504Y2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKDCCQ504Y2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKDCCQ504Y2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKDCCQ504Y2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKDCCQ504Y2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKDCCQ504Y2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKDCCQ504Y2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKDCCQ504Y2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKDCCQ504Y2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKDCCQ504Y2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PKDCCQ504Y2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKDCCQ504Y2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKDCCQ504Y2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKDCCQ504Y2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKDCCQ504Y2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKDCCQ504Y2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKDCCQ504Y2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKDCCQ504Y2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKDCCQ504Y2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKDCCQ504Y2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKDCCQ504Y2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PKDCCQ504Y2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKDCCQ504Y2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKDCCQ504Y2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKDCCQ504Y2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKDCCQ504Y2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PKDCCQ504Y2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PKDCCQ504Y2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PKDCCQ504Y2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PKDCCQ504Y2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKDCCQ504Y2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKDCCQ504Y2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKDCCQ504Y2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKDCCQ504Y2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKDCCQ504Y2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKDCCQ504Y2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKDCCQ504Y2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKDCCQ504Y2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKDCCQ504Y2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKDCCQ504Y2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKDCCQ504Y2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKDCCQ504Y2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKDCCQ504Y2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKDCCQ504Y2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKDCCQ504Y2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKDCCQ504Y2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKDCCQ504Y2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKDCCQ504Y2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKDCCQ504Y2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKDCCQ504Y2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKDCCQ504Y2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKDCCQ504Y2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PKDCCQ504Y2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKDCCQ504Y2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKDCCQ504Y2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKDCCQ504Y2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKDCCQ504Y2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKDCCQ504Y2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKDCCQ504Y2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKDCCQ504Y2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKDCCQ504Y2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKDCCQ504Y2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKDCCQ504Y2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKDCCQ504Y2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKDCCQ504Y2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKDCCQ504Y2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKDCCQ504Y2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKDCCQ504Y2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKDCCQ504Y2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKDCCQ504Y2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms